一株产纤维素酶菌株的筛选、鉴定及全基因组分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 车建美

作者： 车建美;郑雪芳;王阶平;陈燕萍;陈冰星;刘波

作者机构：

关键词： 纤维素酶;藤黄微球菌;生长特性;全基因组;纤维素降解基因

期刊名称： 生物技术通报

ISSN： 1002-5464

年卷期： 2025 年 41 卷 003 期

页码： 294-307

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 【目的】筛选纤维素降解酶活性强的微生物菌株，用于青贮饲料的高效发酵。【方法】从已有菌种库中，利用羧甲基纤维素钠平板筛选产纤维素酶菌株，测定其纤维素酶活性；采用形态观察、生理生化及16S rRNA对菌株进行鉴定；测定该菌株的生长曲线、生长温度及pH、耐盐性等，研究其生长特性；对该菌株的全基因组数据进行生物信息学分析，探究其产纤维素酶基因。【结果】根据透明圈和菌落直径比值D/d，从菌种库中筛选获得比值最大的菌株为FJAT-25102，其48 h时纤维素酶活性为221.81 U/mL，此外，该菌株具有产蛋白酶和淀粉酶能力。经形态特征、生理生化特征及系统发育分析，将菌株FJAT-25102鉴定为藤黄微球菌（Micrococcus luteus）。菌株FJAT-25102在培养2 h后进入生长起始期，在培养26 h时，OD600值达到最大。该菌株在20-50℃、pH 5-11及NaCl浓度为0%-5%时均能生长，具有一定的耐高温性和耐盐碱性。菌株FJAT-25102的基因组由1条环状染色体组成，大小约为2 570 649 bp,GC含量为72.98%。基因组包含2 378个预测的蛋白质编码序列。菌株FJAT-25102中所有可能参与纤维素降解的基因和推定编码的酶包括可能的α-葡萄糖苷酶GH13、内切葡聚糖酶GH74和乙酰木聚糖酯酶CE1、CE7和CE3，其中在FJAT-25102的糖苷水解酶家族中GH13、GH74调控的酶在其降解纤维素的过程中可能起重要作用。菌株FJAT-25102处理的巨菌草青贮饲料的粗纤维、酸性洗涤纤维及中性洗涤纤维含量均显著降低。【结论】所筛选的藤黄微球菌FJAT-250102可为青贮饲料的发酵提供微生物菌株资源，其全基因组的测定及纤维素酶基因的探究可为后续该菌株产纤维素酶机理研究提供基础。

分类号： S816.53

  • 相关文献

[1]产蛋白酶和纤维素酶纳豆芽孢杆菌益生菌株的筛选及其生长特性研究. 孙妍,王加启,奚晓琦,魏宏阳,周凌云. 2011

[2]一株藤黄微球菌高密度培养研究. 陈曦,李国林,陈梦玉,冯镇,龙明秀,林茂. 2015

[3]弧菌拮抗菌的筛选及其效果. 张新明,李健,刘淇. 2004

[4]藤黄微球菌检测氧氟沙星残留方法的研究. 胡晓苗,靳宇田,张玉晴,张丹俊. 2011

[5]微生物全基因组范围内的最小基因组研究进展. 刘晓艳,闵勇,张薇,王开梅,万中义,江爱兵,张光阳,程贤亮,杨自文. 2013

[6]企鹅源禽1型副黏病毒基因组序列分析. 施少华,黄瑜,程龙飞,傅光华,陈红梅,陈珍,苏敬良. 2009

[7]国内新型基因2型牛病毒性腹泻病毒研究进展. 张倩,陶洁,张东,区炳明,林航,杨颖,张信军,朱礼倩,王建业,贺生中,孟婷,谢静,朱国强. 2017

[8]草菇全基因组框架图. 鲍大鹏,赵国屏,谭琦,王升跃,陈明杰,郑华军,张劲松,朱永强,汪虹,康慧,陈祥,林楠,冯爱萍. 2010

[9]长江下游地区地方鸭种全基因组序列测定及遗传多样性分析. 章双杰,王靖,杨建生,李慧芳,宋卫涛,许金根,华国浩,叶彩芳,林雨鑫. 2016

[10]整合REV LTR的自然重组马立克氏病毒GX0101的全基因组序列分析. 周忠文,苏帅,崔宁,孙鹏,孙淑红,崔治中. 2017

[11]猪的全基因组范围内Fox转录因子家族的识别和进化分析. 宫磊,王志鹏,高会江. 2010

[12]Ⅰ型鸭肝炎病毒A66弱毒株全基因组分子克隆及序列分析. 黄显明,张小飞,魏建忠,李春芬,廖俊伟,毛火云. 2009

[13]Asial型口蹄疫病毒第V群猪源和牛源毒株全基因组比较分析. 郑海学,靳野,尚佑军,郭建宏,田宏,杨亚民,刘湘涛,才学鹏. 2010

[14]口蹄疫病毒O型Mya98谱系猪源毒株和牛源毒株全基因组的比较. 吕律,杨帆,何继军,靳野,郭建宏,郑海学,刘湘涛. 2014

[15]黄唇鱼(Bahaba flavolabiata)的全基因组测序和基因组特征研究. 区又君,温久福,李加儿,梁洪海. 2020

[16]藜麦ZF-HD转录因子的全基因组鉴定及其对盐胁迫的响应分析. 时丕彪,王德领,蒋润枝,李斌,晏军,方迪,闫凯旋,顾闽峰. 2022

[17]腺病毒7d基因型与7b基因型全基因组比较分析. 任洛,付扬喜,郑首燕,王鹂鹂,倪科,王莉佳,臧娜,谢晓虹,邓昱,刘恩梅. 2017

[18]木贼镰孢菌D25-1全基因组序列的测定及结构分析. 李雪萍,李建宏,漆永红,郭成,李潇,李敏权. 2019

[19]一株猪捷申病毒全基因组序列测定及分析. 黎少国,张建峰,张春红,沈海燕,刘志成. 2017

[20]苦荞全基因组SSR位点特征分析与分子标记开发. 马名川,刘龙龙,刘璋,周建萍,南成虎,张丽君. 2021

作者其他论文 更多>>

微信小程序