牡丹试管苗生根前后的转录组分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 符真珠

作者： 符真珠;徐梦岚;袁欣;王慧娟;李艳敏;张和臣

作者机构：

关键词： 牡丹;试管苗;休眠;转录组

期刊名称： 分子植物育种

ISSN： 1672-416X

年卷期： 2020 年 18 卷 024 期

页码： 8030-8038

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 牡丹试管苗移栽成活率低的主要原因在于试管苗在生根诱导后发生休眠,导致试管苗弱小,严重影响成活率.为了研究试管苗发生生根休眠的分子机理,本研究对试管苗生根前后(生根培养0,15 d,30 d,45 d)地上部分进行高通量转录组测序,结果显示:测序共获得97.45 Gb Clean Data,各样品Clean Data均达到7.71 Gb,Q30碱基百分比在94.31%以上.组装后共获得43 741条Unigene,其中长度在1 kb以上的Unigene有15 830条.将所有Unigene在NR、Swiss-Prot、KEGG、COG、KOG、GO、Pfam等数据库中进行序列功能注释,共获得26488条Unigene的注释结果.通过GO分类和KEGG Pathway富集性分析,这些Unigene分别归于43个GO类别和128条代谢途径.不同生根培养时期差异表达基因分析显示,生根培养15 d较生根培养前,有1 416个基因上调,1 170个基因下调;生根培养30 d较生根培养15 d,有1 961个基因上调,1 344个基因下调;而生根培养45 d较生根培养30 d,只有201个基因上调,367个基因下调.这些差异表达基因在KEGG生物通路中,以参与能量物质代谢、植物激素信号转导及次生物质合成等代谢途径富集显著.本研究为进一步挖掘试管苗发生生根休眠的相关调控基因提供理论依据.

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