不同蛋白含量大豆籽粒的转录组分析及蛋白合成相关基因预测

文献类型： 中文期刊

第一作者： 张黎杰

作者： 张黎杰;刘书华;周玲玲

作者机构：

关键词： 大豆;蛋白含量;转录组测序

期刊名称： 北方农业学报

ISSN： 2096-1197

年卷期： 2022 年 50 卷 004 期

页码： 1-10

摘要： [目的]筛选大豆蛋白合成相关转录因子,预测蛋白合成候选基因和代谢通路.[方法]以低蛋白大豆材料中豆4901和高蛋白大豆材料淮豆98-28为研究对象,采用RNA-Seq技术,对不同蛋白含量的大豆籽粒进行高通量测序.[结果]获取到43.14 Gb Clean Data,每个样品数据量都在6.46 Gb以上,GC含量在45.73%以上,Q20碱基百分比在94.78%以上,Q30碱基百分比在88.53%以上,数据质量符合要求.获得差异表达基因的总数为916个,其中,上调的差异基因有248个、下调的差异基因有668个.筛选出差异的转录因子属于26个转录因子家族,可能参与大豆蛋白合成的转录因子家族有4个,分别为b HLH、AP2/ERF、MYB、B3.[结论]大豆蛋白的内质网加工途径中蛋白传导通道的Sec61基因发生下调,导致蛋白合成能力下降,品种蛋白含量降低,推测Sec61基因是蛋白合成的关键基因.造成品种间蛋白差异的相关代谢途径与蛋白内质网加工、硫代谢、谷胱甘肽代谢等通路紧密相关.

分类号： S565.1%Q753

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