猪源牛病毒性腹泻病毒SD0803株3′非编码区的克隆及结构分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 邓宇

作者： 邓宇;袁世山;童武;单同领;文心田

作者机构：

关键词： 牛病毒性腹泻病毒;3′非编码区;3′RACE;结构分析

期刊名称： 中国兽医科学

ISSN： 1673-4696

年卷期： 2013 年 09 期

页码： 958-962

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 为了研究猪源牛病毒性腹泻病毒(BVDV)SD0803株3′非编码区(3′-UTR)的结构及其在病毒复制与转录中的作用,采用病毒RNA 3′末端加Poly(A)尾的方法与3′RACE技术对SD0803株3′末端序列进行了扩增、克隆与测序,并应用Clustal W、CLC RNA Workbench 4软件对3′-UTR一级与二级结构进行分析。结果表明,SD0803株3′-UTR由186nt组成,与ZM-95、NADL、SD-1株核苷酸同源性分别为85.4%、53.8%、57.5%;SD0803与其他BVDV株一样,其一级结构均存在1个高变区与1个相对保守区;在高变区缺失约40nt;在RNA 3′末端二级结构方面,SD0803株与ZM-95株均具有3个茎-环结构,而与具有4个茎-环结构的牛源BVDV差异较大。

分类号： S852.659.6

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