甘薯PAL基因家族的全基因组鉴定及生物信息学分析
文献类型: 中文期刊
第一作者: 王崇
作者: 王崇;兰孟焦;肖满秋;潘皓;邓佳祺;吴问胜
作者机构:
关键词: 甘薯;PAL基因家族;全基因组鉴定;生物信息学分析
期刊名称: 植物遗传资源学报
ISSN: 1672-1810
年卷期: 2025 年 26 卷 006 期
页码: 1091-1105
收录情况: 北大核心 ; CSCD
摘要: 苯丙氨酸解氨酶(PAL, phenylalanin ammonia-lyase)是苯丙烷代谢途径中的关键酶和限速酶,在植物生长发育、抗逆等方面发挥重要作用。本研究在甘薯全基因组中筛选PAL基因家族成员,对甘薯PAL基因家族成员的理化性质、系统进化、保守结构域、染色体定位及基因表达进行了分析。结果表明:在甘薯全基因组中共鉴定出33个PAL成员,不均匀地分布于2、6、9和15号染色体上,PAL蛋白理化性质差异小,保守基序和基因结构相近。IbPAL启动子上存在多个逆境胁迫应答、激素响应和生长发育调控相关的顺式作用元件。甘薯IbPAL与拟南芥、三浅裂野牵牛和三裂叶薯PAL基因存在共线性关系。甘薯转录组数据显示,IbPAL基因在甘薯中的表达存在组织特异性,IbPAL19、IbPAL13、IbPAL7在储藏根的表达量明显高于未分化根和须根。qRT-PCR结果显示IbPAL基因受到干旱和盐胁迫的诱导,在不同胁迫处理下表达模式不同。本研究为进一步探明甘薯PAL家族基因的功能提供了参考,为甘薯遗传改良奠定了基础。
分类号: S531
- 相关文献
[1]陆地棉膜结合脂肪酸去饱和酶基因家族的全基因组鉴定及表达分析. 陈义珍,李浩,傅明川,王立国,刘任重,柳展基. 2023
[2]甜瓜TCP基因家族全基因组的鉴定与表达分析. 李海伦,高宁宁,郭姚淼,孙东玲,王月玲,谢夔熙,李鹏飞,段世享,赵卫星,杨森. 2025
[3]甘薯CLE多肽家族的全基因组鉴定和IbCLE12的克隆及抗旱性表达分析. 周媛媛,赵春玲,侯夫云,李爱贤,秦桢,王庆美,董顺旭. 2023
[4]甘薯、番茄和拟南芥中丝氨酸羟甲基转移酶基因家族功能研究. 赵玉琪,周志林,唐君,姚改芳,胡康棣,张华. 2022
[5]甘薯果糖-1,6-二磷酸醛缩酶5基因(IbFBA5)的克隆与生物信息学分析. 苏在兴,李强,唐维,刘亚菊,后猛. 2015
[6]马铃薯PAL基因家族的全基因组鉴定及其在非生物胁迫下和块茎花色素苷合成中的表达分析. 朱金勇,刘震,曾钰婷,李志涛,陈丽敏,李泓阳,史田斌,张俊莲,白江平,刘玉汇. 2023
[7]茶树PAL、C4H与4CL基因家族的全基因组鉴定及表达分析. 张力岚,杨军,王让剑. 2024
[8]小麦几丁质酶基因家族的全基因组鉴定及禾谷镰刀菌胁迫下的表达分析. 徐武,刘建丰,张戈,徐文,袁祖丽. 2019
[9]辣椒BES1基因家族鉴定及表达分析. 孟纯阳,魏小春,赵艳艳,原玉香,王志勇,杨双娟,姜俊,张晓伟. 2019
[10]菜用大豆液泡膜内在蛋白(TIPs)基因鉴定及表达分析. 冯志娟,徐盛春,刘娜,张古文,胡齐赞,龚亚明. 2018
[11]大豆分枝相关CYC/TB1-Like(CYL)基因鉴定及菜用大豆品种的激素表达谱分析. 冯志娟,刘娜,张古文,徐盛春,龚亚明. 2019
[12]葡萄CHX基因家族全基因组鉴定及生物信息学分析. 杜宜洋,连红娟,李晓梅,谭敏,杨镕兆,刘政海,杨兆亮,唐晓萍,董志刚,李捷. 2020
[13]大豆NIP类水孔蛋白基因的鉴定及表达特性分析. 吴伟,冯志娟,徐盛春,刘娜,张古文,胡齐赞,龚亚明. 2018
[14]玉米GATA基因家族的全基因组鉴定及热胁迫下的表达分析. 王延召,周波,韩小花,黄保,鲁晓民,程军玲,王淑凤,聂利红. 2020
[15]高粱耐冷基因全基因组鉴定及进化分析. 张国琴,葛玉彬,张正英. 2020
[16]梨CDPK基因家族全基因组序列鉴定分析. 许园园,李晓刚,李慧,蔺经,常有宏. 2015
[17]菠萝SPL基因家族全基因组鉴定及其在开花诱导中的表达分析. 潘晓璐,张秀梅,许婷婷,侯世贵,张红娜. 2020
[18]谷子GRAS转录因子家族的全基因组鉴定、表达分析及标记开发. 王智兰,韩康妮,杜晓芬,李禹欣,连世超,王军. 2022
[19]砀山酥梨TCP基因家族全基因组鉴定与分析. 冀志蕊,董庆龙,谷彦冰,吴建圆,迟福梅,徐成楠,张俊祥,乔壮,周宗山. 2017
[20]阳桃R2R3-MYB家族成员鉴定及其在木质素合成过程中的表达. 赵亚梅,陈蕾,吴春梅,秦思,翟俊文,任惠,吴沙沙. 2021
作者其他论文 更多>>
-
马铃薯品种(系)资源的SSR遗传多样性分析及指纹图谱构建
作者:孙小琼;王芳;王崇;王舰;杨新笋
关键词:马铃薯;遗传多样性;SSR标记;指纹图谱
-
扶桑绵粉蚧在温室甘薯上的空间分布与抽样技术
作者:黄建华;肖满秋;任广兵;兰孟焦;吴问胜
关键词:扶桑绵粉蚧;甘薯;空间分布;抽样技术
-
甘薯新品种赣薯8号
作者:兰孟焦;肖满秋;潘皓;卢凌志;侯隆英;葛瑞华;吴问胜
关键词:作物研究所;甘薯新品种;非主要农作物;大中薯率;半直立;干物率;鲜薯产量;茎蔓
-
三十烷醇纳米制剂对冬小麦抗旱生理特性的影响
作者:张鑫;王崇;李丽;王超;马海洋;邢佳伊;王耀生
关键词:三十烷醇;水滑石纳米载体;冬小麦;水分利用效率;抗旱性
-
甘薯地上害虫和天敌的发生动态及时空生态位
作者:黄建华;杨迎青;陈洪凡;肖满秋;兰孟焦;吴问胜
关键词:甘薯;害虫;时间生态位;空间生态位
-
甘薯PHB基因家族的全基因组鉴定和表达分析
作者:梅玉琴;刘意;王崇;雷剑;朱国鹏;杨新笋
关键词:甘薯;PHB基因家族;系统进化;生物信息学;表达分析
-
江西甘薯地方种质资源表型性状的遗传多样性分析
作者:肖满秋;兰孟焦;吴问胜;潘皓;张洋;侯隆英
关键词:甘薯;地方种质资源;表型性状;遗传多样性;江西
