甘薯PAL基因家族的全基因组鉴定及生物信息学分析

文献类型: 中文期刊

第一作者: 王崇

作者: 王崇;兰孟焦;肖满秋;潘皓;邓佳祺;吴问胜

作者机构:

关键词: 甘薯;PAL基因家族;全基因组鉴定;生物信息学分析

期刊名称: 植物遗传资源学报

ISSN: 1672-1810

年卷期: 2025 年 26 卷 006 期

页码: 1091-1105

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 苯丙氨酸解氨酶(PAL, phenylalanin ammonia-lyase)是苯丙烷代谢途径中的关键酶和限速酶,在植物生长发育、抗逆等方面发挥重要作用。本研究在甘薯全基因组中筛选PAL基因家族成员,对甘薯PAL基因家族成员的理化性质、系统进化、保守结构域、染色体定位及基因表达进行了分析。结果表明:在甘薯全基因组中共鉴定出33个PAL成员,不均匀地分布于2、6、9和15号染色体上,PAL蛋白理化性质差异小,保守基序和基因结构相近。IbPAL启动子上存在多个逆境胁迫应答、激素响应和生长发育调控相关的顺式作用元件。甘薯IbPAL与拟南芥、三浅裂野牵牛和三裂叶薯PAL基因存在共线性关系。甘薯转录组数据显示,IbPAL基因在甘薯中的表达存在组织特异性,IbPAL19、IbPAL13、IbPAL7在储藏根的表达量明显高于未分化根和须根。qRT-PCR结果显示IbPAL基因受到干旱和盐胁迫的诱导,在不同胁迫处理下表达模式不同。本研究为进一步探明甘薯PAL家族基因的功能提供了参考,为甘薯遗传改良奠定了基础。

分类号: S531

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