甘薯PHB基因家族的全基因组鉴定和表达分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 梅玉琴

作者： 梅玉琴;刘意;王崇;雷剑;朱国鹏;杨新笋

作者机构：

关键词： 甘薯;PHB基因家族;系统进化;生物信息学;表达分析

期刊名称： 作物学报

ISSN： 0496-3490

年卷期： 2023 年 006 期

页码： 1715-1725

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 蛋白质抑制素（prohibitin, PHB）是在原核生物到真核生物中发现的含有SPFH结构域的蛋白质。植物PHB基因家族参与多种不同生物过程的重要功能,包括生长发育以及对生物和非生物胁迫的响应。目前PHB蛋白在拟南芥、水稻、玉米、大豆、番茄和陆地棉等多种植物中被鉴定。但对甘薯中PHB家族的系统分析仍未确定。本研究鉴定出甘薯11个PHB基因,且对这些保守的蛋白质基序和基因结构的分析显示它们在系统发育亚群中具有高度的保守性。此外,启动子区域预测出与多种激素调节及胁迫相关的顺式作用元件,同时研究发现IbPHB基因在植物不同部位及受到不同的非生物胁迫时的表达模式存在差异。本研究系统分析了甘薯中IbPHB基因的一般特性,为甘薯及其他植物中PHB基因的功能特性研究提供了理论基础。

分类号： S531

  • 相关文献

[1]荔枝铝激活苹果酸转运蛋白基因家族的鉴定及表达分析. 钱义容,王弋,全振炫,郑雪文,李伟才,董晨. 2023

[2]百脉根TALE转录因子家族的鉴定与生物信息学分析. 丘日光,张天缘,杨仕梅,宋莉,赵德刚. 2019

[3]辣椒WOX转录因子家族的鉴定、进化与表达分析. 张烨达,王星,王丽萍,佟静,武占会,高彦魁. 2023

[4]梅花鹿生长激素受体(GHR)基因完整编码区序列生物信息学分析. 宋兴超,杨福合,巴恒星,邢秀梅,魏海军. 2012

[5]受棉铃虫诱导的棉花糖基转移酶UGT基因家族的生物信息学及表达分析. 玛依拉·玉素音,阳妮,徐海江,杨延龙,张大伟,李春平,石必显,赖成霞. 2023

[6]杧果FPPS基因的鉴定和序列分析. 盖江涛,朱敏,党志国,陈华蕊,陈振玺,王鹏. 2016

[7]蔷薇科植物MLO蛋白家族的生物信息学分析. 向贵生,王开锦,晏慧君,李淑斌,周宁宁,唐开学,邱显钦. 2018

[8]栽培种西番莲基因组序列及比较基因组分析. 吴艳艳,刘洁云,田青兰,黄永才,黄伟华,夏秀忠,杨行海,牟海飞. 2020

[9]马鹿生长激素(GH)基因生物信息学预测及分析. 宋兴超,杨福合,刘汇涛,徐超,魏海军,邢秀梅. 2012

[10]蒺藜苜蓿LEA基因家族全基因组分析. 刘志敏,刘文献,贾喜涛,张正社,王彦荣. 2015

[11]高粱糖转运蛋白基因家族全基因组鉴定、分类及表达分析. 徐志军,刘洋,徐磊,安东升. 2019

[12]芒果HMGR家族基因的鉴定、系统进化和表达分析. 盖江涛,王鹏,罗海燕,叶秀旭,陈业渊. 2021

[13]燕麦sHSP基因家族的鉴定及其响应高温及老化的表达分析. 马圆,刘欢,赵桂琴,王敬龙,张然,姚瑞瑞. 2024

[14]可可蔗糖磷酸合成酶基因家族进化及组织表达分析. 李付鹏,秦晓威,伍宝朵,赵溪竹,王华,朱自慧,赖剑雄. 2015

[15]水稻几丁质酶基因家族的全基因组鉴定及表达分析. 潘晓雪,胡明瑜,王忠伟,苏梅,雷开荣,吴红,蒋晓英. 2022

[16]牵牛E3泛素连接酶PNRma1基因的克隆及抗旱相关性分析. 代锦绣,董轩名,倪欢欢,董延龙,金晓霞. 2017

[17]miR-18a-5p在鸡不同生长时期的表达及其生物信息学分析与靶基因预测. 黄正洋,黄华云,穆春宇,李春苗,王钱保,黎寿丰,赵振华. 2021

[18]基于转录组的荔枝GRF基因家族的鉴定及表达分析. 阮城城,胡福初,王祥和,吴凤芝,周文静,吴文碟,周瑞云,陈哲. 2021

[19]大白菜TPS基因家族鉴定及其在高温胁迫下的表达分析. 庞强强,蔡兴来,孙晓东,张文,周曼. 2020

[20]烟草NtMYB44b转录因子基因克隆以及生物信息学和表达分析. 余婧,郭玉双,雷波,张孝廉,赵德刚. 2020

作者其他论文 更多>>

微信小程序