砀山酥梨TCP基因家族全基因组鉴定与分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 冀志蕊

作者： 冀志蕊;董庆龙;谷彦冰;吴建圆;迟福梅;徐成楠;张俊祥;乔壮;周宗山

作者机构：

关键词： 砀山酥梨;TCP基因家族;全基因组鉴定;进化分析

期刊名称： 基因组学与应用生物学

ISSN： 1674-568X

年卷期： 2017 年 02 期

页码： 766-773

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： TCP蛋白是植物特有的转录因子家族之一,在植物生长和发育等多个过程起到重要作用。本研究利用生物信息学方法对砀山酥梨TCP基因家族成员、染色体定位、进化分析、亚组分类、保守域结构和保守元件进行了相关分析。结果显示,梨TCP基因家族含有34个成员;进化分析表明,根据进化树拓扑结构将其分为两类:ClassⅠ和ClassⅡ,其中ClassⅡ可被分为CYC/TB1和CIN两个小组。结构域分析表明,梨TCP基因家族TCP结构域高度保守;保守元件分析表明,梨TCP基因家族包含5个保守元件:元件1是TCP保守域;元件2为R结构域,元件3、4和5为功能尚未鉴定的结构域,所有梨TCP蛋白都含有元件1,ClassⅡ组中CYC/TB1小组包含特异元件2。以上结果将为今后揭示梨TCP基因的功能提供重要的理论基础。

分类号： Q943.2`S661.2

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