冰草EST-SSR引物和小麦EST-SSR引物在黑麦属基因组的通用性分析

文献类型: 中文期刊

第一作者: 李飞

作者: 李飞;代明;段清清;杨燕萍;车永和;张锦鹏;鲁玉清;李秀全;杨欣明

作者机构:

关键词: 冰草EST-SSR;小麦EST-SSR;黑麦属;有效扩增;通用性

期刊名称: 麦类作物学报

ISSN: 1009-1041

年卷期: 2014 年 34 卷 06 期

页码: 13-17

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 为研究黑麦属植物的遗传多样性,开发R基因组特有的分子标记并绘制其遗传连锁图谱,选用1 343对冰草EST-SSR引物和786对小麦EST-SSR引物对新疆杂草黑麦和栽培黑麦(共计6份材料)的全基因组进行了PCR扩增,结果显示,有679对冰草EST-SSR引物能够扩出清晰的条带,占引物总数的50.6%;其中有187对引物在6份黑麦材料基因组中扩增产物表现为多态性,占其引物总数的13.9%,平均每对引物扩增条带数为1.1。有364对小麦EST-SSR引物可扩增出清晰的条带,占其引物总数的46.3%;其中有135对引物在6份黑麦材料基因组中扩增产物具有多态性,占其引物总数的17.1%,平均每对引物扩增条带数为2.0。冰草EST-SSR引物在黑麦中的有效扩增效率高于小麦EST-SSR的有效扩增效率,但扩增多态性后者大于前者。两种来源引物扩增强带比率分别为51.8%和32.6%。结果表明小麦和冰草的EST-SSR引物均可用于黑麦基因组分析研究。

分类号: S512.1

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