水稻全基因组选择信号检测方法比较及选择策略
文献类型: 中文期刊
第一作者: 王君瑞
作者: 王君瑞;郑晓明;崔永霞;李嘉琦;李飞;宋珗;格金月;乔卫华;程云连;张丽芳;姜明国;杨庆文
作者机构:
关键词: 水稻;基因组;选择信号;检测方法比较
期刊名称: 分子植物育种
ISSN: 1672-416X
年卷期: 2025 年 23 卷 017 期
页码: 5644-5658
收录情况: 北大核心 ; CSCD
摘要: 作物经历驯化而来,驯化过程中会在基因组上留下特定的选择信号,对这些选择信号进行研究是挖掘重要功能基因的重要手段之一。当前已经涌现出了大量的统计方法用来检测基因组上的选择信号。因此,为了给研究者提供清晰的选择依据,本研究利用水稻基因组数据,根据选择信号的种类和检测方法,选取8种常用检测选择信号的统计方法对水稻全基因组的选择信号进行检测并进行比较分析,通过水稻主要驯化性状分析和比较不同统计方法的原理和生物学意义,为生物进化研究选择合理的统计分析方法和软件提供一定参考。
分类号: S511
- 相关文献
[1]禾谷类物作的比较基因组研究. 郑康乐. 1996
[2]大粒香基因组重测序分析. 龙武华,刘毅,姜雪,李祖军,吴娴,朱速松. 2024
[3]瓠瓜基因组测定. 吴新义,徐沛,吴晓花,汪宝根,鲁忠富,李国景. 2016
[4]基于RAD-seq简化基因组测序的19个地方鸡种遗传进化研究. 韩威,朱云芬,殷建玫,李国辉,薛倩,张会永,沈海玉,苏一军,窦新红,王克华,邹剑敏. 2020
[5]基于RAD-seq技术分析边鸡保种群体的遗传进化. 李国辉,魏清宇,张会永,殷建玫,薛倩,朱云芬,苏一军,王克华,邹剑敏,韩威. 2019
[6]德国肉用美利奴羊全基因组选择信号检测. 刘佳森,李蕴华,王润元,蒋守军,马万山,王利勇. 2019
[7]肃南牦牛群体遗传结构、选择信号分析和ROH检测. 鲍麒,包鹏甲,马晓明,吴晓云,孟光耀,褚敏,曹红梅,郎建英,安玉峰,梁春年,阎萍. 2022
[8]太湖鹅4个群体保种效果的遗传评价. 刘宏祥,王健,宋卫涛,朱春红,陶志云,徐文娟,章双杰,李慧芳. 2021
[9]基于简化基因组测序的天津猴鸡遗传进化研究. 夏树立,周成浩,赵向华,于海涛,张会永,殷建玫,薛倩,韩威,李国辉. 2022
[10]基于RAD-Seq简化基因组测序分析琅琊鸡的遗传进化. 殷建玫,朱云芬,李国辉,张会永,薛倩,周成浩,蒋一秀,苏一军,韩威. 2023
[11]西藏山羊高海拔适应性的选择信号筛选. 金美林,陆健,费晓娟,卢曾奎,权凯,储明星,狄冉,王慧华,魏彩虹. 2020
[12]京星黄鸡IMF系全基因组选择信号检测分析. 王永丽,刘晓静,崔焕先,文杰. 2022
[13]基于温带和热带玉米群体全基因组F_(ST)和XP-EHH的选择信号检测. 杨宇昕,邹枨. 2019
[14]全基因组选择信号解析野牦牛和天祝白牦牛的遗传差异. 鲍麒,梁春年,郭宪,李吉叶,褚敏,阎萍. 2022
[15]全基因组选择信号检测方法在家畜研究中的应用进展. 阿地力江·卡德尔,刘雪雪,杨敏,玛哈巴·肉孜,蒋琳,马月辉. 2016
[16]家养动物选择信号研究进展. 潘章源,贺小云,王翔宇,郭晓飞,曹晓涵,胡文萍,狄冉,刘秋月,储明星. 2016
[17]不同尾型绵羊全基因组选择信号检测. 刘真,王慧华,刘瑞凿,吴明明,张淑珍,张莉,赵福平,杜立新,魏彩虹. 2015
[18]大白猪和通城猪全基因组选择性清扫分析. 李秀领,杨松柏,唐中林,李奎,刘榜,樊斌. 2012
[19]内蒙古地方绵羊遗传多样性及尾椎数性状相关选择信号研究. 常晨城,白音巴图,周乐,杨彦达,马凤英,刘在霞,王杰,何小龙,付绍印,张文广,石彩霞,刘永斌. 2023
[20]双乾肉羊全基因组SNP/InDel分析及毛色相关候选基因鉴定. 刘正喜,武斌,胡明月,白春艳,赵中利,曹阳,马惠海,闫守庆. 2021
作者其他论文 更多>>
-
越橘果实香气研究进展
作者:林佳琦;刘有春;杨艳敏;张舵;李嘉琦;魏鑫;刘成
关键词:越橘;果实;香气物质;检测方法;影响因素
-
pH值对蓝莓生长及生理影响的机制解析
作者:张舵;刘有春;魏鑫;杨艳敏;孙斌;高树清;李嘉琦;林佳琦;徐艺格;刘成
关键词:蓝莓;pH值;生长;生理机制
-
石林县人参果-花芸豆带状复合种植栽培技术
作者:杨春利;蒋瑜;张丽芳
关键词:
-
中国农业生物多样性保护成就与展望
作者:杨庆文
关键词:
-
近红外光谱技术分析茴香秸秆的营养组成
作者:李钰;李欣荣;刘保仓;邓晓裕;郭涛;史艳丽;年芳;李飞;许辉;徐国延;王新基
关键词:茴香秸秆;非常规饲料;近红外光谱技术;粗饲料;营养成分
-
围产期奶牛的免疫抑制及营养调控
作者:杨松桦;张航宇;李飞;郭龙
关键词:奶牛;围产期;免疫抑制
-
不同生长素对'绿宝石'蓝莓组培苗生长的影响
作者:林佳琦;杨艳敏;魏鑫;刘有春;杨玉春;李嘉琦;徐艺格;刘成
关键词:蓝莓;组培苗;生长素;增殖;生根
