芒果核苷二磷酸激酶(NDPK)基因克隆及表达分析
文献类型: 中文期刊
第一作者: 罗睿雄
作者: 罗睿雄;赵志常;黄建峰;党志国;高爱平
作者机构:
关键词: 芒果;核苷二磷酸激酶;基因克隆;生物信息学分析;表达分析
期刊名称: 热带作物学报
ISSN: 1000-2561
年卷期: 2016 年 37 卷 11 期
页码: 2183-2190
收录情况: 北大核心 ; CSCD
摘要: 采用3′RACE和RT-PCR技术克隆芒果核苷二磷酸激酶基因全长c DNA序列,并用实时荧光定量PCR分析该基因的表达模式。结果表明:Mi NDPK1基因c DNA全长1 019 bp,开放阅读框为447 bp,编码148个氨基酸。Mi NDPK1蛋白定位于细胞质,无信号肽和跨膜区域,具有典型的核苷二磷酸激酶活性结构域和其他磷酸化活性位点;与麻疯树、橡胶树同源性最高为89%,与菠菜同源性最低为82%。Mi NDPK1在芒果各组织中均有表达,以叶片中表达最高,其次是花和果皮;在芒果进入生殖时期的花芽分化期表达量最高,此后在芒果果实发育进程中逐渐降低并趋于平稳。结合病害处理转录组样本中的差异性表达结果,推测芒果Mi NDPK1基因在花芽分化进程、抗病性诱导及免疫应答通路上发挥重要作用。
分类号: S667.7
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