摄食不同饵料草鱼肠道菌群PCR-DGGE指纹图谱构建及分子鉴定

文献类型： 中文期刊

第一作者： 郁二蒙

作者： 郁二蒙;毕香梅;谢骏;王广军;余德光;龚望宝;王海英;李志斐

作者机构：

关键词： 草鱼;饵料;肠道细菌;PCR-DGGE

期刊名称： 生物技术通报

ISSN： 1002-5464

年卷期： 2012 年 0 卷 09 期

页码： 179-184

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 采用免培养的16S rDNA梯度凝胶电泳技术(DGGE)对摄食不同饵料(非膨化饲料组、膨化饲料组和蚕豆组)的草鱼肠道内容物细菌分析建立指纹图谱,并对主要优势条带进行了切胶克隆和测序。PCR-DGGE指纹图谱初步分析发现,非膨化饲料组、膨化饲料组和蚕豆组分别产生了19条、16条和15条可以鉴别的条带,且均有2-3条优势菌条带;非膨化饲料组样品和蚕豆组样品的DGGE指纹图谱的相似性系数为53.6%,非膨化饲料组菌群和膨化饲料组的相似性为39.4%。对PCR-DGGE指纹图谱主要条带进一步回收、克隆和测序,结果共得到25条序列,将所得到的序列在NCBI数据库中同源性分析,发现草鱼肠道内容物细菌群落主要为弧菌科、肠杆菌科和气单胞菌属细菌,其中包括14条不可培养细菌。

分类号： S963

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