罗氏沼虾胚胎发育过程中的转录组

文献类型： 中文期刊

第一作者： 黄光华

作者： 黄光华;彭敏;杨春玲;冯鹏霏;曾地刚;陈秀荔;刘青云;李强勇;张永德;朱威霖;郁二蒙;赵永贞

作者机构：

关键词： 罗氏沼虾;胚胎发育;转录组;基因表达

期刊名称： 水产学报

ISSN： 1000-0615

年卷期： 2025 年 49 卷 002 期

页码： 77-85

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 【目的】为了探索罗氏沼虾胚胎发育的分子调控机制。【方法】本研究对罗氏沼虾胚胎的卵裂期Ⅰ、卵裂期Ⅱ、囊胚期、原肠胚期、前无节幼体、无节幼体、前蚤状幼体、蚤状幼体8个发育阶段进行转录组测序。【结果】本研究共得到156.37 Gb clean data，预测得到22 964个unigenes。对罗氏沼虾8个不同发育阶段的胚胎样品的unigenes进行两两比较分析，获得各个时期之间的差异表达基因数量为587～8 620。对差异表达基因进行GO富集分析，上调表达基因主要富集在与细胞发育、生长、运动相关的GO功能类别，下调表达基因主要富集在与细胞的翻译调控、趋化、抗氧化、排毒活性相关的GO功能类别。KEEG富集分析发现，差异表达基因的pathway主要富集在与细胞的生长发育以及正常的生理生化过程相关的代谢途径。【结论】本研究获得了罗氏沼虾胚胎的大量转录本信息，发现了与胚胎发育相关的差异表达基因及其主要富集功能和途径，为罗氏沼虾胚胎研究提供了有用的转录组信息资源。

分类号： S917.4

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