制干辣椒SCoT-PCR体系优化及引物筛选

文献类型： 中文期刊

第一作者： 李宁

作者： 李宁;杨涛;杨生保;唐亚萍;王柏柯;王强;帕提古丽;余庆辉

作者机构：

关键词： 制干辣椒;SCoT标记;正交设计;体系优化

期刊名称： 南方农业学报

ISSN： 2095-1191

年卷期： 2015 年 46 卷 04 期

页码： 544-549

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 【目的】优化制干辣椒SCo T-PCR反应体系,为新疆制干辣椒种质资源、分子遗传学研究奠定基础。【方法】以制干辣椒为材料,采用L25(55)正交设计方法对影响制干辣椒SCo T-PCR反应体系的Mg2+、模板DNA、引物、DNA聚合酶、d NTPs等因素进行优化筛选。【结果】从25个正交设计组合中筛选获得5个组合的扩增效果较好,扩增条带丰富且清晰度适中、分散性好;经引物SC-12、SC-13、SC-19筛选,获得适用于制干辣椒材料的SCo T-PCR最佳反应体系20.0μL,包含10×Buffer 2.0μL、30 ng模板DNA 0.8μL、2.0 mmol/L Mg2+1.8μL、1.0μmol/L引物1.0μL、1 U Taq DNA聚合酶0.4μL、0.25 mmol/L d NTPs 0.5μL、dd H2O 13.5μL。运用优化体系从80条引物中筛选出扩增条带清晰、多态性丰富的SCo T引物24条。【结论】优化的SCo T-PCR反应体系及筛选的引物可用于新疆制干辣椒种质鉴定、遗传图谱构建、遗传多样性的分析等。

分类号： S641.3

  • 相关文献

[1]适于新疆制干类型辣椒种质资源遗传多样性的SRAP和SCoT分析. 李宁,杨涛,帕提古丽,王柏柯,唐亚萍,许娟,余庆辉,杨生保. 2017

[2]甘蔗黑穗病菌SCoT-PCR反应体系优化与引物筛选. 姜子德,沈万宽,罗明珠,饶得花. 2015

[3]珍稀濒危植物距瓣尾囊草(Urophysa rockii Ulbr)SCoT-PCR分析体系的建立与优化. 张波,陆世家,石力,邹大方,王德怀. 2016

[4]拳卷地钱基因组DNA提取及ISSR-PCR扩增体系优化. 杜沛霖,王跃峰,白燕远,朱华. 2014

[5]正交设计优化大豆SSR-PCR反应体系及引物筛选. 苏辉,李志刚,宋书宏. 2009

[6]马铃薯SSR-PCR反应体系的建立和优化. 张凤军,张永成. 2011

[7]西藏光核桃SRAP-PCR反应体系的优化和引物筛选. 谭江平,曾秀丽,廖明安,邱利娜,王玉霞,次仁卓嘎. 2011

[8]福建省53份茶树种质资源SSR-PCR反应体系的优化. 朱晨,田采云,张舒婷,常笑君,傅海峰,李小桢,陈常颂,林玉玲,郭玉琼. 2018

[9]大白菜EST-SSR反应体系优化及引物筛选. 佟海申,宋琳,张志刚,赵智中,宋希云,李巧云. 2010

[10]芒果SSR-PCR反应体系的优化. 黄丽芳,雷新涛,姚全胜,刘洋,苏俊波,詹儒林. 2010

[11]正交设计优化辣椒SRAP-PCR反应体系及引物筛选. 周坤华,方荣,陈学军,缪南生,王悟亮. 2010

[12]黄绿蜜环菌SSR-PCR反应体系的优化及引物筛选. 李颖,谢占玲,田飞,贾贤卿,方慧,夏明哲. 2013

[13]莲雾SRAP反应体系的优化及其应用. 蔡元保,杨祥燕,黄明忠,曾黎明,崔明勇,陈显国,林玉虹. 2011

[14]椰子SSR-PCR反应体系的优化. 周丽霞. 2017

[15]益智ISSR-PCR反应体系建立与优化. 刘晓静,王文泉,郭凌飞. 2008

[16]辣椒疫霉菌SSR-PCR反应体系的建立及优化. 陶丽婷,杨世鹏,王丽慧,李屹,李莉. 2017

[17]葡萄目标起始密码子多态性反应体系的优化. 张君玉,郭大龙,龚莹,刘崇怀,李猛. 2011

[18]桔梗ISSR反应体系的建立和优化. 于营,郭靖,王志清,邵财,张庆田. 2014

[19]正交优化芒果SRAP扩增体系及引物筛选. 应东山,罗海燕,王明,李莉萍,王琴飞,朱敏,陈业渊. 2014

[20]均匀设计与正交设计优化海岛棉RGA-PCR体系. 李吉琴,孔庆平,陈全家,赵其波,孔杰,宁新民,梁亚军,曲延英. 2009

作者其他论文 更多>>

微信小程序