鸡传染性支气管炎中国地方分离毒株LX4mRNA1ORF1的遗传变异特征

文献类型： 中文期刊

第一作者： 刘胜旺

作者： 刘胜旺;刘玉芬;孔宪刚;邵昱昊

作者机构：

关键词： 冠状病毒;鸡传染性支气管炎;mRNA1ORF1基因;遗传变异

期刊名称： 病毒学报

ISSN： 1000-8721

年卷期： 2004 年 20 卷 4 期

页码： 347-352

收录情况： CSCD

摘要： 应用RT-PCR方法扩增了冠状病毒鸡传染性支气管炎中国分离毒株LX4的mRNA1 ORF1,并将其进行了克隆、序列测定和分析.表明LX4mRNA1基因包含2个ORF,其中ORF1a由11 916个核苷酸组成,编码一条3 971个氨基酸残基组成的多肽.ORF1b由7 950个核苷酸组成,编码2 649个氨基酸残基组成的多肽.与美国Beaudette株对应的ORF1a核苷酸及推导的氨基酸序列同源性均为85%,与对应的ORF1b的同源性分别为89%和95%.二者ORF1a和ORF1b重叠区推测的"滑脱序列"(slippery sequence)核苷酸序列一致,"假结"(pseudoknot)基本结构相似.不同之处在于"假结"第2环中LX4的第7位为A,而Beaudette株在该位置为G.与Beaudette株比较,LX4 ORF1a核苷酸变异最频繁的区域集中在第2 656～3 098位碱基处,且在该区域有60个碱基的插入,导致推导的氨基酸序列插入了20个氨基酸残基.LX4 ORF1b序列缺失9个核苷酸,主要集中在第5 168～5 181位之间,导致对应的氨基酸缺失3个.但这些差异是否与病毒的生物学特性有关不明.

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