新疆乌鲁木齐10号冷泉古菌群落结构多样性

文献类型： 中文期刊

第一作者： 李萍

作者： 李萍;曾军;祖丽皮亚·玉努斯;高小其;董秀黄;薛娟;娄恺

作者机构：

关键词： 含硫冷泉;古菌;16S rRNA基因克隆文库;断裂带

期刊名称： 微生物学报

ISSN： 0001-6209

年卷期： 2013 年 53 卷 03 期

页码： 230-240

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 【目的】探究新疆地震断裂带含硫冷泉泉水古菌群落组成及多样性。【方法】利用酶解法直接从冷泉泉水样品中提取环境总DNA,采用古菌通用引物对16S rRNA基因进行扩增,构建16S rRNA基因克隆文库,通过Alu I和Afa I两种限制性内切酶对随机挑选的115个阳性克隆子进行酶切分型,将不同酶切带型对应的克隆子送样测序,测序结果与GenBank序列进行比对并构建16S rRNA基因系统发育树。【结果】古菌克隆文库中共得到44个不同的酶切带型,BLAST序列比对和系统发育分析将它们划分于广古菌门(Euryarchaeota,94.78%)和奇古菌门(Thaumarchaeota,4.35%)。奇古菌门克隆与Nitrosopumilus.sp序列相似性达到了93%;而广古菌门类群较为多样,其中,42.61%的克隆子属于RC-V cluster,20.87%与13.91%的克隆子分别属于LDS cluster和Methanomicrobiales,4.35%的克隆子与甲烷厌氧氧化相关的类群(ANME-1a-FW)具有较高的的相似。另外,13.05%的克隆子属于广古菌门中的未知类群。【结论】乌鲁木齐10号泉水体中广古菌类群多样,可能蕴藏有大量潜在的古菌新类群。

分类号： Q938.8

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