舟山近海环境DNA保存方法的建立及优化

文献类型： 中文期刊

第一作者： 陈治

作者： 陈治;陈建威;王晓艳;高天翔;刘岩

作者机构：

关键词： 舟山近海;eDNA保存;酒精+低温;二次过滤

期刊名称： 海洋与湖沼

ISSN： 0029-814X

年卷期： 2019 年 005 期

页码： 1098-1107

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 近年来,环境DNA(environmentalDNA,eDNA)技术开始被广泛应用于水生生物多样性研究.本文通过绝对定量和高通量测序技术对舟山近海高浊度水样eDNA的保存方法进行了建立和优化.研究结果如下:(1)"酒精+低温"保存法的eDNA获得量是"酒精+常温"保存法的0.78-1.06 (7d)、0.89-1.80 (15d)、1.05-2.75 (30d)和2.69 (60d)倍;(2)酒精保存法(低温、常温)存在eDNA富集物渗漏及滤膜黏附现象;(3)短期内冷冻保存样品的eDNA获得量是酒精保存样品获得量的1.25-1.59倍(7d)和1.07-1.20倍(15d);(4)酒精保存法的eDNA降解速率慢于冷冻保存法,长期内酒精保存样品的eDNA获得量是冷冻保存样品获得量的1.99-2.10倍(30d)和2.84-7.64倍(60d);(5)二次富集(过滤)能显著提高eDNA获得量,富集组eDNA浓度是未富集组浓度的1.60-4.95倍("酒精+低温")和1.21-2.04倍("酒精+常温");(6)"酒精+低温"保存的样品在高通量测序总丰度、各鱼种分丰度、物种多样性指数等多个方面优于冷冻保存样品;(7)微生物(micro-organism)的eDNA降解速率慢于大生物(macro-organism),不同界(Kingdom)的eDNA最优保存方法可能并不相同.本研究首次建立了舟山近海高浊度水样eDNA最适保存方法,为相似水域的eDNA保存提供了借鉴参考.

分类号： Q16

  • 相关文献

[1]舟山近海棘头梅童鱼群体遗传多样性微卫星DNA分析. 林能锋,苏永全,丁少雄,王军. 2011

[2]珠江河口水体环境DNA提取方法的建立及优化. 李红婷,张帅,邹柯姝,陈作志,陈晓雷,蒋佩文,曹漪婷,李敏. 2022

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