苦瓜(Momordica charantiaL.)McGS1基因的克隆及结构预测

文献类型： 中文期刊

第一作者： 申龙斌

作者： 申龙斌;申丹艳;牛玉;刘子记;党选民;扬衍

作者机构：

关键词： 苦瓜;谷氨酰胺合成酶;氮肥

期刊名称： 分子植物育种

ISSN： 1672-416X

年卷期： 2015 年 13 卷 05 期

页码： 1079-1085

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 本研究以热研3号苦瓜总RNA为模板,采用RT-PCR和RACE技术,获得苦瓜谷氨酰胺合成酶基因,并命名为McGS1。生物信息学分析表明:苦瓜McGS1基因全长1 302 bp,其中CDS序列长度为1 071 bp,编码356个氨基酸;蛋白分子量为39.14 kD,等电点(pI)为5.49,元素组成为:C1751H2685N479O525S9,N末端主要为疏水性的氨基酸,而C端亲水性氨基酸较多;利用软件进行预测发现该蛋白没有跨膜区,说明它不是一个跨膜蛋白,同时发现该蛋白不存在信号肽;其蛋白质二级结构中,α-螺旋占28.37%,延伸链占17.42%,β-折叠占5.34%,无规则卷曲占48.88%;同源性比对发现苦瓜McGS1蛋白与甜瓜和黄瓜中的GS1蛋白亲缘关系最近,相似度分别达到了94.66%和95.22%。本研究结果可为进一步研究谷氨酰胺合成酶基因在苦瓜氮代谢中的调控作用提供理论参考。

分类号： S642.5

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