水稻白叶枯病候选抗性基因SHNLR的RGAs克隆及分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 张颖

作者： 张颖;王长春;胡海涛;张维林;严成其;杨玲

作者机构：

关键词： RGAs法;水稻;白叶枯病抗性基因;克隆;表达分析

期刊名称： 生物技术通报

ISSN： 1002-5464

年卷期： 2012 年 0 卷 04 期

页码： 51-57

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 旨在从含有疣粒野生稻抗白叶枯病基因的新种质SH5、SH76基因组中克隆抗病基因。利用RGAs法得到1个NBS-LRR类同源基因,暂命名为SHNLR(登录号为JF934724)。结果表明,SHNLR的开放阅读框长度为3 105 bp,编码1 034个氨基酸,含有CC、NB-ARC与LRR结构域,具备CC-NBS-LRR类植物抗病基因的结构特征。BLASTn和BLASTp比对显示SHNLR是单拷贝基因,未发现同源性较高且功能已知的基因,仅NBS保守域序列与番茄Prf基因的相似度最高。对SHNLR基因电子定位,发现其位于水稻第11号染色体的长臂末端,但与11号染色体上已定位或克隆的8个白叶枯病抗性基因具有不同序列或处于不同的位置。半定量RT-PCR分析表明,SHNLR在抗病新种质叶片中的表达明显受到白叶枯病菌Zhe173的诱导。因此推测SHNLR可能是1个与抗白叶枯病相关的R基因。

分类号： S511

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