罗非鱼TRAP分子标记反应体系优化设计方案的比较

文献类型： 中文期刊

第一作者： 马庆男

作者： 马庆男;董在杰;朱文彬;苏胜彦;张宁;袁新华;杨弘

作者机构：

关键词： 罗非鱼;TRAP;正交设计;单因素试验;优化

期刊名称： 南方水产科学

ISSN： 2095-0780

年卷期： 2013 年 9 卷 01 期

页码： 28-34

收录情况： CSCD

摘要： 靶位区域扩增多态性(target region amplification polymorphism,TRAP)是一种新型功能性分子标记,比较了L16(45)正交试验和单因素方法优化罗非鱼(Oreochromis spp.)TRAP反应体系。2种分析方法结果中dNTPs浓度、随机引物浓度、DNA浓度相同而镁离子(Mg2+)浓度和TaqDNA聚合酶浓度不同,不同因素间存在一定的交互作用。正交设计方法比单因素法更简单、科学、合理。该试验获得罗非鱼15μL TRAP最优反应体系为DNA模板浓度为60 ng、Mg2+浓度为1.5 mmol.L-1、dNTPs浓度为0.3 mmol.L-1、TaqDNA聚合酶0.5 U、随机引物浓度为7 pmol.L-1和固定引物浓度为10 pmol.L-1。该反应体系在4个罗非鱼群体中验证,表现出良好的稳定性和重复性,该反应体系的建立为TRAP标记应用于罗非鱼遗传多样性评价、种质鉴定、分子标记辅助育种等研究提供了新的手段。

分类号： S917.4

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