鳙长江中下游群体的D-loop序列遗传分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 傅建军

作者： 傅建军;朱文彬;罗明坤;王兰梅;董在杰

作者机构：

关键词： 鳙;线粒体DNA;D-loop序列;种群多样性;遗传分化

期刊名称： 上海海洋大学学报

ISSN： 1674-5566

年卷期： 2024 年 33 卷 003 期

页码： 521-532

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 为了探究长江中下游鳙的种质遗传现状,该研究收集了石首(SS)、长沙(CS)、瑞昌(RC)、扬州(YZ)和张家港(ZJG)的长江种群(YR,219尾),对其D-loop序列进行检测分析,并结合NCBI下载整理的珠江种群(PR,213尾)和北美种群(NA,33尾)开展比较研究.结果显示,在YR、PR和NA的D-loop序列中分别检测到35、96和11个变异位点,并分别界定37、62和3个单倍型.在长江中下游的5个鳙群体中,单倍型多样性(Hd)为0.798~0.897,核苷酸多样性(π)为0.003 38~0.006 53.长江中下游5个鳙群体间,RC与ZJG(FST=0.012)和CS与YZ(FST=0.018)的遗传分化不显著,其余群体间均存在显著遗传分化(FST为0.031~0.125);群体间检测到不同程度的基因流(Nm为3.509~39.993).基于单倍型网络分析,长江中下游的鳙D-loop序列单倍型存在多个分支,并在群体间存在明显的共享;YR和PR的中心单倍型存在广泛共享,PR的特有单倍型均为外围单倍型,并推测NA的形成存在不同的遗传来源.基于中性检验结果,推测PR在历史上经历过种群扩张.研究表明,长江和珠江的鳙种群维持了较高的遗传多样性,可为其种质资源保护和利用奠定物质基础.

分类号： S917.4

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