玉米二态性InDel位点的鉴定和分子标记开发

文献类型： 中文期刊

第一作者： 周玲

作者： 周玲;梁帅强;林峰;吕远大

作者机构：

关键词： 玉米;二态性InDel位点;系统发育树;群体结构

期刊名称： 江苏农业学报

ISSN： 1000-4440

年卷期： 2016 年 32 卷 06 期

页码： 1223-1231

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 随着下一代测序技术(Next generation sequencing,NGS)的发展,可以利用高通量测序数据挖掘基因组特异的插入/缺失(In Del)位点,这使In Del分子标记的开发成为可能。本研究利用327份玉米自交系的测序数据,通过全基因组结构变异评估发现分布于10条染色体上的25 847个In Del位点。利用PIC值≥0.30的3 304个位点进行系统发育树构建和群体结构分析,其结果与利用SNP位点分析获得的结果高度一致,说明这些多态性较高的In Del位点可以作为代表性标记用于玉米遗传组成的差异分析。采用53对PCR引物进行扩增试验,发现这些In Del引物具有位点专化特征并且其杂交种鉴定的平均杂合率为0.569 2,表明这些标记能准确鉴定出玉米杂交种的杂合度。

分类号： S513

  • 相关文献

[1]5个宽体金线蛭种群遗传多样性和遗传分化的SNP分析. 高凯利,马学艳,王海华,李涵,李燕华,金武,闻海波. 2024

[2]玉米新品种吉单50产量构成指标与高产栽培技术研究. 臧薪宇,任禾,李强,高红军,彭畅,朱平. 2012

[3]玉米群体结构对年际间气象因子变化的反应. 李海燕,史振声,李凤海,吴玉群,杨翠翠,王志斌,王宏伟,吕香玲,朱敏. 2013

[4]栽培方式对玉米群体结构的调控效应. 齐华,梁熠,赵明,王敬亚,吴亚男,刘明. 2010

[5]基于SNP芯片揭示中国玉米育种种质的遗传多样性与群体遗传结构. 赵久然,李春辉,宋伟,王元东,张如养,王继东,王凤格,田红丽,王蕊. 2018

[6]种植密度与田间配置对玉米群体结构的影响. 王明泉. 2014

[7]基于40个核心SSR标记揭示的820份中国玉米重要自交系的遗传多样性与群体结构. 刘志斋,吴迅,刘海利,李永祥,李清超,王凤格,石云素,宋燕春,宋伟彬,赵久然,赖锦盛,黎裕,王天宇. 2012

[8]北疆麦田非传统套种新玉9号高产群体结构研究. 付斌军,郭斌,赵新俊. 2008

[9]福建省玉米小斑病菌的致病型及其群体结构分析. 甘林,代玉立,阮宏椿,石妞妞,杜宜新,陈福如,杨秀娟. 2018

[10]不同玉米品种间、混种植栽培的技术探讨. 史振声,张喜华,李凤海,王志斌,王宏伟. 2006

[11]密植型玉米“中单909”高产群体结构特征. 刘荣,张卫建,齐华,宋振伟,贾倩. 2013

[12]紧凑型玉新杂交种群体结构特点和变化动态. 王庆成,刘开昌. 1998

[13]密度对不同株型玉米群体结构的调控效应. 郭江,郭新宇,郭程瑾,张凤路,赵春江,肖凯. 2008

[14]中国黄淮海地区玉米杂种优势候选位点的鉴定. 周玲,梁帅强,吕远大,张体付,戴惠学. 2017

[15]基于DUS测试性状的黄淮海地区玉米自交系的遗传多样性及群体结构分析. 豆丹丹,孙建军,郭玉玺,王德新,郭新海,丁超明. 2023

[16]淮北地区小麦玉玉产量15000kg/ha栽培体系研究报告. 汪芝寿,曹承富. 1996

[17]169份不同遗传背景玉米自交系的遗传多样性分析. 邹成林,黄开健,黄爱花,莫润秀,翟瑞宁,杨萌,韦新兴. 2025

[18]贵州中药材钩藤属植物的分子鉴定. 陶刚,刘涛,朱英,刘作易. 2008

[19]中国甘薯小象甲的rDNA ITS-1遗传变异及入侵来源研究. 于海滨,沈江卫,马娟,马辉杰,陈书龙. 2011

[20]亚洲玉米螟化性遗传规律研究. 黄艳玲,袁海滨,李启云,高月波,张正坤,王振营. 2015

作者其他论文 更多>>

微信小程序