ToCV和TYLCV复合侵染番茄后部分病毒基因序列分析及实时荧光定量PCR分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 宋建

作者： 宋建;薛俊;金凤媚;孙海波;张越;王姝;范寰;周祥明;陈锐

作者机构：

关键词： 番茄黄化曲叶病毒;番茄褪绿病毒;复合侵染;序列分析;实时荧光定量PCR

期刊名称： 华北农学报

ISSN： 1000-7091

年卷期： 2019 年 02 期

页码： 95-102

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 番茄褪绿病毒病(ToCV)和番茄黄化曲叶病毒(TYLCV)存在复合侵染的现象,其发病率逐年递增,成为一种新的威胁番茄产业的病毒病害。为了研究复合侵染样品中2种病毒的互作和基因变异情况,对天津番茄产区发生的TYLCV全基因组和ToCV的CP基因和HSP基因进行了克隆和序列分析。结果表明,与单独侵染样品进行比对,TYLCV的基因序列在复合侵染的样品中共有6处碱基发生了变异,分别为73位A→C、92位A→G、347位C→T、1 209位C→T、1 618位A→G、2 107位A→T,除73位和92位的变异未在编码区,其余的变异碱基均在ORF框内,其中1 209位为同义突变,其他均发生了错义突变。ToCV的CP基因有1处同义突变,ToCV的HSP基因共有4处碱基变异,其中826位由T→C和1 166位由G→A均为同义突变,1 395位和1 630位均由A→G,为错义突变。利用实时荧光定量PCR技术对单独侵染和复合侵染的番茄样品中TYLCV和ToCV病毒积累量进行分析。结果表明,在田间单独侵染和复合侵染的样品中, TYLCV的拷贝数差异不显著,ToCV的拷贝数在单独侵染和复合侵染的样品中差异也不显著。在复合侵染的样品中,TYLCV的拷贝数约为ToCV的262～436倍。

分类号： S436.412.11

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