新吉细毛羊皮肤组织均一化全长cDNA文库的质量评价

文献类型： 中文期刊

第一作者： 詹振宏

作者： 詹振宏;黄锡霞;田可川;吴伟伟;哈尼克孜·吐拉甫;田月珍;马依拉·吐尔逊;艾买提·买买提;何丽

作者机构：

关键词： 新吉细毛羊;cDNA文库;质量评价;ESTs序列分析

期刊名称： 新疆农业大学学报

ISSN： 1007-8614

年卷期： 2013 年 36 卷 04 期

页码： 269-274

收录情况： 北大核心

摘要： 通过对已构建新吉细毛羊皮肤组织的均一化全长cDNA文库进行活化,在此基础上进行EST生物信息学分析研究,期望能发现影响细毛羊羊毛性状的主效基因或相关基因。运用菌落PCR、菌液PCR、质粒快速鉴定3种方法对cDNA文库进行评价,通过测序,在NCBI上BLASTn搜索、比对及运用DNAstar等软件进行分析。初步鉴定的结果:cDNA文库的库容量(滴度)为1.57×106 pfu/mL,菌落PCR、菌液PCR阳性克隆的小片段率在80%~90%,克隆的片段大小在0.6~2.0kb,cDNA在300~500bp,而质粒快速鉴定的在90%,克隆的片段载体带大小3.5~5.0kb。质粒快速鉴定的效果好于其他两种方法,耗时相对短,同时小片段率高;cDNA文库保存完好,符合基因文库的质量要求,有足够大的库容量来保证筛选目的基因。通过对筛选的阳性克隆5’端随机测序,随后获得可读序列169条,经过相关生物信息查询之后,发现其中可能含有完整基因。

分类号： S826.81

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