全基因组选择信号筛选和田羊异质被毛相关候选基因

文献类型： 中文期刊

第一作者： 张彦威

作者： 张彦威;徐新明;于丽娟;田月珍;谢梦婉;唐丽苹;郑培宇;宋楠楠;狄江

作者机构：

关键词： 和田羊;被毛类型;候选基因;选择信号

期刊名称： 新疆农业科学

ISSN： 1001-4330

年卷期： 2025 年 62 卷 003 期

页码： 766-774

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 【目的】被毛类型是绵羊重要的品种特征之一，但是其形成的分子基础目前仍不清楚。筛选出与和田羊异质被毛有关的基因和通路，为进一步解析和田羊异质被毛的分子调控机制提供理论依据。【方法】对异质被毛和田羊和同质被毛中国美利奴羊的基因组信息进行选择信号分析，研究筛选出与和田羊被毛类型相关的候选基因。选取健康和田羊和中国美利奴羊成年母羊各15只，颈静脉采血，提取基因组DNA进行基因组重测序，基于全基因SNPs进行选择信号检测分析。将Fst和θπRatio的top1%作为阈值，筛选出SNPs位点进行注释，并对注释基因进行GO功能和KEGG通路富集分析，确定与和田羊异质被毛性状相关的候选基因和生物学通路。【结果】Fst和θπRatio两种方法共鉴别出732个受选择基因，这些基因被显著富集到多个与羊毛性状有关的KEGG通路和1条与毛囊发育有关的生物学过程通路。【结论】筛选出多个羊毛性状有关的通路和5个(BMPR2、LPAR6、RARA、CDC6和BNC1)可能与和田羊异质被毛相关的关键候选基因。

分类号： S826

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