基于重测序鉴定SbHKT基因在陆地棉基因组中的插入位点

文献类型： 中文期刊

第一作者： 徐鹏

作者： 徐鹏;郭琪;徐珍珍;孟珊;陈天子;沈新莲

作者机构：

关键词： 陆地棉;重测序;SbHKT;插入位点;侧翼序列

期刊名称： 棉花学报

ISSN： 1002-7807

年卷期： 2021 年 004 期

页码： 377-383

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 【目的】明确SbHKT基因棉花HKT-1株系的插入位点序列特征。【方法】对HKT-1株系重测序,本地BlastN比对获得插入位点处的侧翼序列,设计聚合酶链式反应（Polymerase chain reaction,PCR）特异引物验证插入位点的准确性。【结果】获得SbHKT基因插入位点处107 bp的左边界（Left border,LB）端侧翼序列HKT1＿LSEQ,122 bp的右边界（Right border,RB）端侧翼序列HKT1＿RSEQ;锚定基因组后显示SbHKT基因的插入引发了陆地棉染色体结构变异。分别根据LB和RB端侧翼序列设计PCR特异引物扩增HKT-1株系T-DNA全长,目的条带含有完整的T-DNA骨架序列以及Sb HKT基因序列,证实HKT1＿LSEQ和HKT1＿RSEQ是同一个插入位点的左右侧翼序列。【结论】基于重测序技术获得了Sb HKT基因在陆地棉基因组中的侧翼序列,建立了SbHKT基因转化体特异性检测方法。

分类号：

  • 相关文献

[1]外源抗草甘膦EPSPs基因在大豆基因组中的整合与定位. 王晓波,蒋凌雪,魏利,刘林,陆伟,李文欣,王俊,陶波,常汝镇,邱丽娟. 2010

[2]烟草T-DNA插入位点侧翼序列扩增方法的筛选与优化. 刘慧,刘贯山,刘峰,龚达平,张雪峰,崔萌萌,路铁刚,王元英. 2014

[3]转GbVe1基因在棉花基因组中的整合与定位分析. 陈天子,凌溪铁,杨郁文,张保龙. 2019

[4]耐盐转基因大豆事件AtARA6-A001外源插入片段侧翼序列及其应用. 孙星邈,侯云龙,王英哲,关诗宇,邱红梅,张玲. 2024

[5]希金斯刺盘孢T-DNA插入突变体表型筛选及其特性分析. 周鹏,顾琼楠,黄俊斌,郑露. 2019

[6]抗病毒转基因大豆事件外源T-DNA序列分析及定性检测. 刘东波,邢国杰,赵倩倩,杨静,牛陆,杨向东,仲晓芳. 2020

[7]鸡痘病毒复制非必需位点的筛选及鉴定. 张雪梅,赵妍,张晓彩,王云峰. 2015

[8]转录因子OsHOX4过量表达及T_1代转基因植株中纯合系鉴定. 张云华,Kurniawan Rudi Trijatmiko,郭立华,Inez Hortense Slamet-Loedin,邱德文. 2012

[9]理性认识转基因促进生物育种技术健康发展. 张春义. 2011

[10]插入序列ISRso21在青枯雷尔氏菌中的分布以及插入位点多态性分析. 车建美,林海云,刘波,林营志. 2014

[11]转cry1C基因抗虫水稻吉生粳3号外源基因整合分析与品系特异性检测. 金永梅,马瑞,于志晶,林秀峰. 2019

[12]“转基因”产业化发展之必要. 黄大昉. 2013

[13]口蹄疫病毒外源序列插入位点的研究进展. 张岩,胡永浩,杨帆,郑海学. 2014

[14]口蹄疫病毒外源序列插入位点的研究进展. 张岩,胡永浩,杨帆,郑海学. 2013

[15]不同TAIL-PCR通用引物在转基因大豆、水稻、油菜侧翼序列分离中的应用评价. 陈笑芸,汪小福,刘仁虎,张小明,周育,缪青梅,徐俊锋. 2013

[16]稻曲病菌T-DNA插入突变体B2510的插入位点分析. 丁慧,俞咪娜,王亚会,于俊杰,尹小乐,薄惠文,黄星,刘永锋. 2016

[17]水稻基因组上一个Ds切离及其双位点插入行为的分子鉴定. 赵丁丁,乔中英,程孝,王建平,焦翠翠,孙丙耀. 2014

[18]转Bt-pta-bar基因玉米侧翼序列分析及特异性检测方法研究. 董立明,于维,李葱葱,张明,李飞武. 2013

[19]富集宏基因组DNA中α淀粉酶全长基因的克隆及重组表达. 曾丽娟,廖思明,王青艳,杜丽琴,韦宇拓,黄日波. 2010

[20]高效、新T-DNA侧翼序列分离技术——Actail-PCR. 杨立勇,刘灶长,周立国,罗华程,罗利军. 2009

作者其他论文 更多>>

微信小程序