不同播期条件下大豆开花期性状的全基因组关联分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 宋晓宇

作者： 宋晓宇;毛婷婷;王立伟;刘丽凤;李晓那;孙石;韩天富

作者机构：

关键词： 大豆;播期;开花期;全基因组关联分析;候选基因

期刊名称： 中国油料作物学报

ISSN： 1007-9084

年卷期： 2018 年 40 卷 04 期

页码： 459-468

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 开花期是决定大豆生态适应性和产量的重要性状,研究大豆开花期的遗传规律,解析大豆开花调控的分子基础,对大豆品种适应性改良具有重要意义。本研究选用来自北方、黄淮海和南方三大生态区的87份中国品种及31份美国大豆品种,在北京进行春、夏季分期播种,获得10个播期环境下的开花期数据,并利用Illumina BARCSoy SNP6K iSelect Bead Chip芯片对大豆品种进行SNP分型。通过群体结构分析、聚类分析和PCA分析,将供试大豆品种分为两个亚群。利用TASSEL软件PCA+K模型,结合5 126个SNP标记,对开花期进行全基因关联分析,得到18个显著关联位点,其中14个位点在2个以上的环境中稳定表达,4个位点只在单一环境中被检测到,表明其受光温环境影响较大。18个位点中有11个尚未见报道,分别位于3、4、5、9、10、14、16和17号染色体上,可能存在控制大豆开花期的新基因。通过对显著关联位点进行预测,共发现31个候选基因,其中有2个(Glyma10g36600和Glyma19g37890)已在此前的研究中被证明与大豆开花有关,而Glyma03g33470、Glyma11g15650、Glyma05g01510和Glyma19g07162与拟南芥中相关的开花调控基因同源,推测这4个基因在大豆中也参与开花调控。

分类号： S565.1

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