eDNA监测空间分辨率量化方法研究-以长江中游干流平水期为案例

文献类型： 中文期刊

第一作者： 杨海乐

作者： 杨海乐;许兰馨;周琼;刘志刚;吴金明

作者机构：

关键词： 环境DNA监测;空间分辨率;可信度与覆盖度;流域生物信息流;流域生态学

期刊名称： 长江流域资源与环境

ISSN： 1004-8227

年卷期： 2024 年 004 期

页码： 855-869

收录情况： 北大核心 ; CSCD ; CSSCI

摘要： eDNA监测技术有助于提高水生生物种类组成监测和种群健康监测的效率，而eDNA监测的空间分辨率未量化阻碍了常态化系统化eDNA监测的实施。为了量化eDNA监测的空间分辨率，探索建立了一个基于流域生物信息流分析框架和eDNA监测空间分辨率概率化表述的量化方法，并在长江中游开展了案例研究。2020年6月（平水期）在长江中游设置30个采样断面，断面间隔在30 km左右，开展eDNA采样，进行高通量测序（原核生物用16S rRNA基因扩增子测序、真核生物用线粒体COI基因扩增子测序）,根据流域生物信息流分析框架计算eDNA所能监测到的生物信息输移的量化特征，确定eDNA监测空间分辨率（系列）值及其可信度、覆盖度。结果显示长江中游平水期，eDNA监测原核生物达到90%以上覆盖度对应的空间分辨率为27 km（可信度为84.18%）,监测真核生物达到90%以上覆盖度对应的空间分辨率为6 km（可信度为41.38%）,达到80%以上覆盖度对应的空间分辨率为13 km（可信度为50.64%）;监测原核生物达到90%以上可信度对应的空间分辨率为58 km（覆盖度为82.30%）,监测真核生物达到90%以上可信度对应的空间分辨率为78 km（覆盖度为38.61%）,达到80%以上可信度对应的空间分辨率为50 km（覆盖度为49.70%）。研究结果可为其它eDNA监测空间分辨率估算工作提供方法借鉴，为长江中游eDNA监测断面设置提供量化参考。

分类号： X835

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