菠萝R2R3-MYB基因家族鉴定与表达分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 陈哲

作者： 陈哲;胡福初;阮城城;范鸿雁;郭利军;张治礼

作者机构：

关键词： 菠萝;R2R3-MYB;生物信息学;乙烯利;基因表达

期刊名称： 热带作物学报

ISSN： 1000-2561

年卷期： 2019 年 010 期

页码： 1958-1971

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： R2R3-MYB转录因子参与植物众多生命活动的调控,在植物生长发育中至关重要.本研究采用生物信息学分析方法,从菠萝基因组中筛选鉴定R2R3-AcMYB转录因子,并对其基因结构、编码蛋白和系统进化进行了分析;基于转录组数据和荧光定量PCR分析,研究了乙烯利处理后菠萝顶端分生组织MYB基因的表达模式.研究结果显示,菠萝基因组含有103个R2R3-AcMYB转录因子,其中67个的基因结构组成为3(外显子)+2(内含子),17个为2(外显子)+1(内含子).103个R2R3-AcMYB蛋白中,有31个偏碱性,55个显酸性和17个呈中性.亚细胞定位预测显示,有67个编码蛋白定位于细胞质,20个定位于细胞核.保守基序分析发现,有91个R2R3-AcMYB的序列包含SANT结构的motif 1和motif 2.系统进化树分析表明,81个R2R3-AcMYB转录因子可以分别被归入18个亚组,其余22个R2R3-AcMYB转录因子则未能进行明确归类.基于转录组数据和荧光定量PCR分析结果,发现菠萝顶端分生组织中多个MYB基因的表达受到乙烯利的诱导或抑制,暗示这些基因可能参与了乙烯利诱导条件下菠萝生长发育(包括开花诱导等)调控.这些研究结果为进一步挖掘菠萝激素响应、生长发育和开花调控等基因,揭示菠萝生长发育调控机制提供了数据支持.

分类号： S668.3

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