绵羊(ATAG)n四碱基微卫星位点的筛选及其在亲子鉴定中的应用

文献类型： 中文期刊

第一作者： 胡明月

作者： 胡明月;刘正喜;赵中利;曹阳;马惠海;闫守庆

作者机构：

关键词： 绵羊;分子遗传标记;四碱基重复微卫星;亲子鉴定;基因分型

期刊名称： 中国畜牧兽医

ISSN：

年卷期： 2021 年 007 期

页码： 2484-2494

收录情况： 北大核心

摘要： 本试验旨在筛选绵羊高度多态性四碱基微卫星遗传标记,建立适用于绵羊亲子关系鉴定的实验体系。试验以小尾寒羊为主要研究对象,从已有的绵羊参考基因组序列出发,基于全基因组序列筛选法共筛选出53个（ATAG）n四碱基重复微卫星位点,然后通过基因分型数据共筛选出30个扩增效果好、多态信息含量（PIC）丰富的四碱基重复微卫星位点;30个位点的基因分型结果表明,共扩增出253个等位基因,平均等位基因数为8.433,等位基因数均>5,多态信息含量在0.566～0.898,观测杂合度（Ho）范围在0.548～0.903,期望杂合度（He）范围在0.631～0.921,平均期望杂合度为0.776;哈代-温伯格平衡检验30个位点均处于遗传平衡状态。随后根据PCR的扩增效率从获得的30个多态性位点中筛选出22个微卫星位点用于亲权排除概率的计算,根据多态信息含量的大小由高到低依次增加位点数进行组合。结果表明,在两个亲本的基因型均未知的情况下,标记位点数为15个时,累积排除概率可达到99.99%,其中单个位点的第一非亲排除率（non-exclusion probability of the first parent, NE-1P）介于0.321～0.663之间。利用建立的亲子鉴定体系对16只具有系谱记录的小尾寒羊样本进行检测,结果共鉴定出4个具有高置信度的绵羊家系,鉴定结果与系谱记录完全一致。本试验为绵羊分子系谱的构建、亲子鉴定以及保障绵羊育种工作的正常开展奠定重要基础。

分类号： S826.2

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