基于SSR标记的雪茄烟种质资源指纹图谱库的构建及遗传多样性分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 王琰琰

作者： 王琰琰;王俊;刘国祥;钟秋;张华述;骆铮珍;陈志华;戴培刚;佟英;李媛;蒋勋;张兴伟;杨爱国

作者机构：

关键词： 雪茄烟;种质资源;SSR标记;遗传多样性;指纹图谱

期刊名称： 作物学报

ISSN： 0496-3490

年卷期： 2021 年 007 期

页码： 1259-1274

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 为从分子水平研究我国雪茄烟种质资源的遗传多样性差异并建立雪茄烟品种的DNA指纹图谱数据库,本研究利用43对多态性好的SSR引物对220份雪茄烟种质进行遗传多样性分析,筛选出14对核心引物对雪茄烟种质进行指纹图谱的构建。结果表明,43对SSR引物在220份雪茄烟种质材料中共扩增出243个等位基因,平均每个标记5.65个,变幅为2～13,每个位点的多态性信息量（polymorphism information content,PIC）变化为0.2078～0.9087,平均为0.6360。有效等位基因数（number of effective alleles, Ne）范围为1.3081～11.7876,平均有效等位基因数为3.9077;观测杂合度（observed heterozygosity, Ho）变化范围为0.0828～0.7639,平均为0.3191;预期杂合度（expected heterozygosity,He）的变化范围为0.2361～0.9172,平均为0.6809;种群平均Shannon遗传多样性指数（Shannon genetic diversity index,I）为1.3756,遗传距离在0.0233～0.9286之间,平均遗传距离0.6816。聚类分析表明,在遗传距离为0.74处,可将供试雪茄烟资源分为3个类群。Structure群体遗传结构分析和主成分分析将所有的供试材料划分为2个类群。根据引物的分析和表型鉴定结果,确定良种、辅善和满耳朵,山东大叶和牡丹江05-1,Florida513和CA0701为异名同种,一个品种保留一份种质,剩余216份不同种质。从43对SSR引物中筛选出14对可区分所有供试材料的SSR引物作为核心引物构建了216个雪茄烟品种的指纹图谱。我国雪茄烟种质资源具有较高水平的遗传多样性,本研究构建的雪茄烟种质资源SSR指纹图谱库及遗传分析的结果在分子水平上为筛选、鉴定优质雪茄烟种质资源、挖掘重要基因以及拓宽雪茄烟遗传育种基础等工作提供科学依据。

分类号： S572

  • 相关文献

[1]92份雪茄烟原料种质资源遗传多样性研究. 向小华,刘国祥,张兴伟,夏长剑,李媛,陈荣平,杨菁,赵文涛,吴达,李方友,吕洪坤. 2021

[2]部分常用水稻品种的指纹图谱构建和遗传多样性分析. 刘春林,甘玉姿,辛业芸. 2016

[3]浙江省46个粳稻新品种SSR指纹图谱构建及遗传多样性分析. 李小华,叶胜海,赵小燕,姚坚,刘继云,陈蕾,翟荣荣,金庆生,张小明. 2014

[4]津南芹菜EST-SSR指纹图谱的构建及遗传差异分析. 兰青阔,李欧静,张继波,赵新,朱珠,陈锐,徐石勇,王永,郭永泽. 2012

[5]金银花SSR指纹图谱的构建及遗传多样性分析. 徐石勇,李欧静,张舒玮,邓慧,刘征辉,王永,兰青阔. 2015

[6]基于SSR标记的刺参不同地理群体的遗传结构分析及指纹图谱构建. 廖梅杰,王锦锦,李彬,王印庚,荣小军,张正,范瑞用. 2021

[7]大麦DUS测试标准品种的遗传多样性分析及指纹图谱的构建. 王艳平,沈奇,张继红,李华勇,吴燕. 2013

[8]基于SSR标记的藜麦种质资源遗传多样性分析与指纹图谱构建. 陈翠萍,刘洋. 2022

[9]基于SSR标记的葡萄品种(系)遗传多样性分析与指纹图谱构建. 郭春苗,李宁,周晓明,樊丁宇,谢辉,张付春,潘明启,卢春生. 2015

[10]基于SSR标记的向日葵DNA指纹图谱构建. 冯飞,汪磊,傅春玲,谭美莲,汪魏,严兴初,王力军. 2018

[11]藜麦SSR指纹图谱构建及遗传多样性分析. 陈翠萍,闫殿海,张书苗,左皓南,高森,刘洋. 2023

[12]花生种质遗传多样性分析及指纹图谱构建. 徐彪,牛海龙,刘红欣,李伟堂,王伟,李玉发,吴松权,何中国. 2024

[13]利用中国秋大豆（Glycine max(L.)Merr)筛选SSR核心位点的研究. 谢华,常汝镇,曹永生,张明辉,冯忠孚,邱丽娟. 2003

[14]青萝卜种质遗传多样性分析与指纹图谱构建. 郑思宇,范伟强,王超楠,张红,黄志银,李梅,刘晓晖,张胜雪,华德平,张斌. 2022

[15]基于SSR标记的新疆塔里木河流域柽柳指纹图谱构建及遗传多样性分析. 叶春秀,姜继元,董鹏,庄振刚,陈奇凌,谢宗铭. 2015

[16]60份辣椒骨干亲本的SSR遗传多样性分析及指纹图谱构建. 雷刚,陈学军,周坤华,黄月琴,袁欣捷,李歌歌,方钰,方荣. 2024

[17]中国黄瓜主栽品种SSR遗传多样性分析及指纹图谱构建. 苗晗,张圣平,顾兴芳,王烨,陈磊. 2014

[18]山东省46个花生品种SSR指纹图谱构建与遗传多样性分析. 胡晓辉,毛瑞喜,苗华荣,石运庆,崔凤高,杨伟强,陈静. 2016

[19]利用SSR标记构建我国亚麻品种DNA指纹图谱及遗传多样性分析. 潘根,张义,赵立宁,陈安国,李建军,黄思齐,唐慧娟,常丽,张翠萍,邓勇,李德芳. 2019

[20]我国茶树主要骨干亲本及其衍生品种(系)的SSR分析. 段云裳,姜燕华,王丽鸳,成浩,房婉萍,黎星辉. 2011

作者其他论文 更多>>

微信小程序