用于玉米品种真实性鉴定的最优核心SNP位点集的研发

文献类型： 中文期刊

第一作者： 田红丽

作者： 田红丽;杨扬;范亚明;易红梅;王蕊;金石桥;晋芳;张云龙;刘亚维;王凤格;赵久然

作者机构：

关键词： 玉米品种;真实性鉴定;SNP位点集;高鉴别力

期刊名称： 作物学报

ISSN： 0496-3490

年卷期： 2024 年 005 期

页码： 1115-1123

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 品种真实性是种子质量监测的一个重要指标。为建立准确可靠、快速简便、高通量、低成本的玉米品种真实性鉴定技术,本文利用200个核心SNP位点构建的5816个玉米杂交品种, 3274个自交系的指纹数据,基于遗传算法、品种识别率评估确定了一套高鉴别力的核心SNP位点集,包含96个SNP位点。这96个SNPs全部位于基因内区域,相对均匀分布在10对染色体上。采用上述杂交品种和自交系的指纹数据评估显示这96个位点具有较高多态性和品种区分能力,PIC、MAF、DP平均值分别为0.36、0.40、0.60和0.36、0.39、0.48,对杂交品种、自交系的品种识别率达到99.14%和99.24%。两两样品成对比较结果显示,99.99%的品种间差异位点数目≥3个,杂交品种和自交系中96.74%和95.67%的成对比较差异位点数目集中在30～65个和30～60个。基于221个主推杂交品种的40个SSR位点、96个SNP位点的基因型数据分析结果显示,这2组标记集的鉴定结果具有较高的一致性。综上所述,本研究报道了一套具有位点数量最少、区分能力最强,兼容多平台、适于自动化分型等优点的最优核心SNP集。期望位点集将在玉米品种真实性监测、种子质量控制中得到广泛应用,进而维护玉米种子市场秩序、保障育种者权利以及保护农民利益。

分类号： S513

  • 相关文献

[1]杂交水稻Ⅱ优084品种真实性的分子检测. 王波,彭宏,李媛媛. 2012

[2]花生品种鉴定技术研究进展. 张建成,江玉萍,王传堂,李汝玉,李群,袁文业. 2006

[3]利用SSR标记快速检测甜瓜'天美55,种子纯度与真实性. 李肯,武云鹏,彭冬秀,张若纬. 2022

[4]基于SSR分子标记的节水抗旱稻品种真实性检测. 周佩雯,孔德艳,刘毅. 2021

[5]利用SSR快速鉴定棉花品种真实性和纯度. 王欣怡,艾先涛,王俊铎,梁亚军,龚照龙,郑巨云,郭江平,买买提·莫明,李雪源. 2017

[6]玉米真实性SSR鉴定标准的研制及应用. 王凤格,易红梅,赵久然,田红丽,任洁,葛建镕,王璐. 2016

[7]SSR标记鉴定玉米品种真实性及纯度的研究. 沈童伟,陆徐忠,刘勋辉,李莉,杨剑波. 2009

[8]基于SSR分子标记的‘汇丰2号’辣椒杂交种子纯度和真实性鉴定. 赵威,徐晓美,徐小万,衡周,王恒明,陈金金,吴智明. 2023

[9]SNP分子标记及其在作物品种鉴定中的应用. 田海燕,张海娜,王永强,周永萍,张莹璐. 2024

[10]基于SSR分子标记的‘粤秀3号’黄瓜杂交种子纯度及真实性鉴定. 金庆敏,林毓娥,王瑞,钟玉娟,吴廷全. 2023

[11]基于iPBS标记的石斛兰杂交子代真实性鉴定. 赵秋菊,崔学强,邓杰玲,黄昌艳,李佳蔚,张自斌. 2023

[12]利用SSR标记快速检测甜瓜‘天美55’种子纯度与真实性. 李肯,武云鹏,彭冬秀,张若纬. 2022

[13]基于SSR标记的区试棉花品种纯度和真实性鉴定. 赵程杰,钟文,王文良,张传云,杜召海,陈煜,张军. 2020

[14]利用SSR标记和SNP芯片对小麦EMS突变体进行真实性鉴定. 耿皆飞,王娜,蒋宏宝,刘录祥,许喜堂,魏红升,王成社,谢彦周. 2019

[15]稳定同位素质谱在植源性食品真实性鉴定和产地溯源中的应用综述. 孙雨茜,王宁,杨晨晔,王同. 2021

[16]SSR和SNP两种标记技术在玉米品种真实性鉴定中的比较分析. 李雪,田红丽,王凤格,赵久然,李云伏. 2014

[17]玉米品种真实性鉴定中SSR技术体系的优化. 刘勋辉,陆徐忠,钟昌松,马卉,汪名春,李莉,杨剑波. 2008

[18]影响吉林省玉米产量的因素. 冯艳春,郑洪兵,杜鹃,姚丽影. 2016

[19]裉饲兼用玉米中原单32号的育成与推广. 唐秀芝,张维强. 2001

[20]适于滨海平原区种植的玉米品种筛选. 李辉,刘毅,孙彦铭. 2015

作者其他论文 更多>>

微信小程序