猫importin基因生物信息分析及其在犬细小病毒感染F81细胞表达的动态变化

文献类型： 中文期刊

第一作者： 赵航

作者： 赵航;宋姗姗;王建科;林鹏

作者机构：

关键词： 输入蛋白;犬细小病毒(CPV);序列分析;表达差异

期刊名称： 中国畜牧兽医

ISSN： 1671-7236

年卷期： 2020 年 012 期

页码：

收录情况： 北大核心

摘要： 试验旨在系统研究猫源不同亚型importin (importinα1、importinα3、importinα4、importinα5、importinα6、importinα7、importinα8和importinβ)基因序列和蛋白基本特性,探讨其在犬细小病毒(canine parvovirus,CPV)感染F81细胞表达的动态变化.本研究利用RT-PCR方法扩增F81细胞中improtin基因全长序列,应用生物学软件预测其氨基酸序列及编码蛋白的结构及功能;进一步利用实时荧光定量RT-PCR技术检测importin基因在CPV感染F81细胞后24、48和72 h表达水平.结果显示,不同亚型importinα基因全长约在1 500 bp,而importinβ基因全长为2 600 bp;预测importin亚型蛋白序列发现,其等电点均在4.60左右,且发现importinα1、importinα5、importinα6、importinα7和importinβ为不稳定蛋白;分析发现这些importin蛋白均无信号肽、无跨膜区、无细胞定位;采用Predictprotein软件预测蛋白二级结构,结果显示importin亚型蛋白序列主要以α-螺旋和无规则卷曲形式存在.实时荧光定量RT-PCR结果显示,CPV感染F81细胞后随着感染时间的延长importinα1(P<0.01)和importinβ表达量逐渐降低,而importinα3、importinα4、importinα5、importinα6(P<0.01)、importinα7(P<0.01)和importinα8(P<0.01)表达量逐渐提高,其中importinα8在病毒感染细胞后表达量最高.本研究结果为进一步分析CPV进入细胞核的转运机制及开发治疗药物相关研究奠定基础.

分类号： S858.293

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