苹果TIFY家族基因鉴定及其在虫害胁迫下的表达分析

文献类型: 中文期刊

第一作者: 梅闯

作者: 梅闯;张小燕;闫鹏;艾沙江·买买提;冯贝贝;马凯;韩立群;董连新;王继勋

作者机构:

关键词: 新疆野苹果;基因家族;TIFY;表达分析;茉莉素

期刊名称: 园艺学报

ISSN: 0513-353X

年卷期: 2021 年 002 期

页码: 233-242

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 利用生物信息学方法在苹果全基因组中鉴定了TIFY转录因子家族基因,对基因结构、蛋白保守基序和进化关系进行了分析,同时基于新疆野苹果(Malussieversii)转录组数据分析,明确了苹果TIFY家族基因在虫害胁迫条件下的差异表达情况。共鉴定到了16个苹果TIFY基因,其蛋白质大小介于209~449aa之间。16个TIFY基因分布于苹果8条染色体中,所有的MdTIFY蛋白都具有保守的TIFY结构域。其中8个苹果Md TIFY与新疆野苹果转录组测序拼接转录本对应,这些基因均含有保守的TIFY功能域,多物种进化分析表明该类蛋白可聚类成7个组。7个TIFY基因的表达量在不同处理间表现出显著差异,虫害侵染后,抗虫株系中MsTIFY10B-a表达量升高34倍,MsTIFY9-c上升5.2倍。同时抗虫株系在自然条件下茉莉酸—异亮氨酸含量显著高于敏感株系。新疆野苹果中重要抗虫响应基因MsTIFY10B-a和MsTIFY9-c位于预测关联网络节点中心位置,使它们在调节植物对生物胁迫的响应中发挥重要作用。

分类号: S661.1

  • 相关文献

[1]高粱糖转运蛋白基因家族全基因组鉴定、分类及表达分析. 徐志军,刘洋,徐磊,安东升. 2019

[2]基于转录组的百香果ARF基因家族的鉴定及表达分析. 张小雪,韦晓霞,陈发兴. 2021

[3]甜樱桃GH3基因家族全基因组鉴定与表达分析. 侯黔东,沈天娇,余欢欢,仇志浪,文壮,张惠敏,吴亚维,文晓鹏. 2021

[4]基于转录组的荔枝GRF基因家族的鉴定及表达分析. 阮城城,胡福初,王祥和,吴凤芝,周文静,吴文碟,周瑞云,陈哲. 2021

[5]菠萝TCP基因家族的鉴定及成花诱导阶段的表达谱分析. 阮城城,胡福初,罗志文,王祥和,郭利军,李玉静,范鸿雁,韩冰,陈哲,张治礼. 2020

[6]桃WRKY基因家族全基因组鉴定和表达分析. 谷彦冰,冀志蕊,迟福梅,乔壮,徐成楠,张俊祥,周宗山,董庆龙. 2016

[7]辣椒紫色酸性磷酸酶基因家族的鉴定与表达特征. 程远,郭勤卫,郑佳秋,万红建. 2017

[8]大蒜WRKY基因家族的鉴定与生物信息学分析. 隋淑梅,黄思杰,田洁. 2023

[9]基于转录组的荔枝泛素结合酶基因家族的鉴定及表达分析. 董晨,李金枝,郑雪文,王弋,李伟才. 2022

[10]巴西橡胶树FKBP基因家族成员的鉴定及表达分析. 晁金泉,杨署光,陈月异,田维敏. 2018

[11]香蕉苯丙氨酸解氨酶基因家族的全基因组鉴定及表达分析. 杨会晓,孙媛媛,贾彩红,金志强,徐碧玉,王卓. 2019

[12]石榴SUT基因家族鉴定及其在籽粒发育过程中的表达分析. 骆翔,曹尚银,李好先,赵弟广,张富红,陈丽娜,Krishna Poudel,敬丹,唐丽颖. 2020

[13]荔枝GA2ox基因家族的鉴定及表达分析. 陈哲,王祥和,周文静,周瑞云,吴文碟,吴凤芝,范鸿雁,胡福初. 2021

[14]转录组荔枝Dof基因家族的鉴定及其表达. 董晨,魏永赞,王弋,郑雪文,李伟才. 2021

[15]菠萝酸性转化酶基因家族初步生物信息学及表达分析. 宋康华,侯晓婉,贾志伟,洪克前,谷会,张鲁斌. 2020

[16]巴西橡胶树膜联蛋白基因家族成员的鉴定和表达分析. 肖小虎,隋金蕾,戚继艳,方永军,王闯,唐朝荣. 2016

[17]巴西橡胶树钙调蛋白基因的克隆和表达分析. 肖小虎,隋金蕾,戚继艳,阳江华,秦云霞,唐朝荣. 2016

[18]巴西橡胶树APX基因家族成员的鉴定及表达分析. 晁金泉,杨署光,陈月异,田维敏. 2018

[19]亚麻纤维素合酶超基因家族的生物信息学及表达分析. 袁红梅,郭文栋,赵丽娟,于莹,吴建忠,张利国,程莉莉,赵东升,吴广文. 2016

[20]藜麦SPP基因家族全基因组鉴定及表达模式分析. 陈紫岩,林参,尹航,张豪杰,魏真真,余希文,吴传万,李茹. 2022

作者其他论文 更多>>