苹果TIFY家族基因鉴定及其在虫害胁迫下的表达分析
文献类型: 中文期刊
第一作者: 梅闯
作者: 梅闯;张小燕;闫鹏;艾沙江·买买提;冯贝贝;马凯;韩立群;董连新;王继勋
作者机构:
关键词: 新疆野苹果;基因家族;TIFY;表达分析;茉莉素
期刊名称: 园艺学报
ISSN: 0513-353X
年卷期: 2021 年 002 期
页码: 233-242
收录情况: 北大核心 ; CSCD
摘要: 利用生物信息学方法在苹果全基因组中鉴定了TIFY转录因子家族基因,对基因结构、蛋白保守基序和进化关系进行了分析,同时基于新疆野苹果(Malussieversii)转录组数据分析,明确了苹果TIFY家族基因在虫害胁迫条件下的差异表达情况。共鉴定到了16个苹果TIFY基因,其蛋白质大小介于209~449aa之间。16个TIFY基因分布于苹果8条染色体中,所有的MdTIFY蛋白都具有保守的TIFY结构域。其中8个苹果Md TIFY与新疆野苹果转录组测序拼接转录本对应,这些基因均含有保守的TIFY功能域,多物种进化分析表明该类蛋白可聚类成7个组。7个TIFY基因的表达量在不同处理间表现出显著差异,虫害侵染后,抗虫株系中MsTIFY10B-a表达量升高34倍,MsTIFY9-c上升5.2倍。同时抗虫株系在自然条件下茉莉酸—异亮氨酸含量显著高于敏感株系。新疆野苹果中重要抗虫响应基因MsTIFY10B-a和MsTIFY9-c位于预测关联网络节点中心位置,使它们在调节植物对生物胁迫的响应中发挥重要作用。
分类号: S661.1
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