绵羊痘病毒RP030基因的克隆及序列分析
文献类型: 中文期刊
第一作者: 赵志荀
作者: 赵志荀;吴国华;颜新敏;李健;朱海霞;孙晓林;张强
作者机构: 甘肃农业大学动物医学院;家畜疫病病原生物学国家重点实验室
关键词: 绵羊痘病毒;RPO30基因;序列分析;生物信息学
期刊名称: 中国农学通报
ISSN: 1000-6850
年卷期: 2011 年 027 卷 007 期
页码: 304-308
收录情况: CSCD
摘要: 选择羊痘病毒RNA聚合酶RPO30进行分析,为进行RNAi羊痘病毒研究,进行目的基因的初步筛选.PCR扩增RPO30基因,连入pMD18-T simple载体并转化DH5a大肠杆菌.经蓝白斑筛选挑选白斑制备质粒,经双酶切、PCR及测序鉴定.结果成功克隆了RPO30基因,克隆的SSPV RPO30基因ORF 为585 bp,编码193个氨基酸,阅读框内有一个HindⅢ酶切位点,测序结果与GenBank数据库中不同痘病毒毒株之间同源性存在着明显区别.进一步经过生物学软件分析表明RPO30蛋白质氨基酸4-12、18-26、50-161、68-92,176-190位之间区域形成活性中心的可能性较大,选择这些区域进行作用可能会造成该基因产物酶的失活,从而高效抑制病毒的复制.
分类号: R852.659.1
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