Asia1型口蹄疫病毒VP1蛋白进化踪迹分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 牛银杰

作者： 牛银杰;王靖飞

作者机构：

关键词： Asia 1型口蹄疫病毒;VP1蛋白;踪迹进化分析;同源建模

期刊名称： 中国预防兽医学报

ISSN： 1008-0589

年卷期： 2014 年 36 卷 08 期

页码： 615-619

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 为预测口蹄疫病毒(FMDV)VP1蛋白的重要功能残基,本研究利用进化踪迹及蛋白结构同源建模等方法对91株Asia 1型FMDV的VP1氨基酸序列进行分析,结果显示91个病毒株分属于B、C和D分支,2005年~2006年分离株处于另一个分支,命名为E分支。以10分区分析进化树,共34个组特异残基,其中140S、141S、146L、148A、149L、150A、151R、152R、153V、155N和156R分布于G-H环区域,预测它们与抗原性和受体结合特性有关;B、C、D和E 4个分支的组内特异残基分别为24S、153G、196H;59H、141P、146M、150S、169N;50I、135A和99N、127S、140S、151R,这些残基为各分支的分子标识;组特异残基35V、80L、93S、127A分布于VP1和其他结构蛋白的作用界面,可能对病毒的装配具有重要作用。本研究结果为FMDV的VP1功能研究提供了参考数据。

分类号： S852.65

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