基因芯片技术鉴定棉铃虫胁迫后棉花差异表达基因

文献类型: 中文期刊

第一作者: 武娟

作者: 齐放军;田文华;韩榕;张永军;郭予元

作者机构:

关键词: 棉花;虫害胁迫;基因芯片;差异表达

期刊名称: 农业生物技术学报

ISSN: 1674-7968

年卷期: 2011 年 19 卷 05 期

页码: 130-137

收录情况: 北大核心

摘要: 棉花在受到植食性昆虫为害后基因表达会发生变化,筛选鉴定这些调控基因有助于解析昆虫诱导棉花抗虫性的分子机制。本研究以棉花(Gossypium spp.)(中12)为实验材料,分别从正常生长条件下的棉花(对照)和棉铃虫(Helicoverpa armigera Hübner)取食胁迫6、12、24和48h的棉花叶片(处理)中提取总RNA,采用Affymetrix棉花基因芯片进行了基因表达谱分析。结果表明,棉铃虫取食6h时,差异表达基因共有4109个(占28%),其中上调1917个,下调2192个;棉铃虫取食12h时,差异表达基因共有2605个(占18%),其中上调1326个,下调1279个;棉铃虫取食24h时,差异表达基因共有3213个(占22%),其中上调1424个,下调1789个;棉铃虫取食48h时,差异表达基因共有2763个(占19%),其中上调1450个,下调1313个。进行生物信息学分析后发现,这些基因功能涉及氧化应激响应、防御响应、信号转导、转录调控、黄酮类生物合成、萜类化合物合成与代谢以及源于多种氨基酸的罗勒生物碱生物合成等多个方面。另外,从芯片结果中鉴定获得调控棉花特异性挥发物的相关基因,发现法呢基焦磷酸合酶基因的表达量受昼夜节律的影响,同时,棉铃虫取食棉花诱导杜松萜烯合酶基因表达量上调。实时荧光定量PCR检测发现,棉铃虫取食6h的棉株中法呢基焦磷酸合酶基因和查尔酮异构酶基因表达量较高,而在被棉铃虫取食48h的棉株中这两个基因的表达量较低。研究结果为棉花受棉铃虫为害后产生的防御机制的研究提供了基础资料,进一步为植食性昆虫取食诱导植物产生萜烯类化合物提供了依据。

分类号: S435.622

  • 相关文献

[1]虫害胁迫棉花基因表达谱的生物信息学分析. 田文华,齐放军,张永军,吴孔明,郭予元. 2011

[2]芸苔链格孢菌与白菜互作基因表达谱芯片分析. 刘影,徐文静,杜茜,杨信东,李启云. 2010

[3]应用表达谱基因芯片筛选植物激活蛋白处理水稻相关差异基因. 黄丽俊,邱德文,刘峥,左斌,杨秀芬,王建华. 2005

[4]棉花中HD-Zip Ⅳ家族基因的全基因组鉴定及特征分析. 王瑞,朱伟王瑞,鲁丽丽,刘拓,章志强,马宗斌,李伶俐,刘伟,杨作仁. 2017

[5]棉花腺体形成相关的miRNA差异表达研究. 何晓红,孙全,江怀仲,莫剑川,袁有禄,石玉真. 2011

[6]陆地棉突变体腺体形成时期的基因表达谱. 陈敏,江明锋,蔡应繁,孙全,何晓红,江怀仲,谢永芳,莫剑川,高运玲,潘正,陈珺,伍婷玉,王玲,朱小燕,张锐,袁友禄,石玉真. 2010

[7]转录组比较分析中棉所63与亲本的叶片和幼蕾基因表达差异. 杨代刚,周晓箭,王海风,孟清芹,裴小雨,张文生,周克海. 2012

[8]根据基因芯片筛选棉花产量性状相关的基因. 张利媛,于霁雯,张金发,李兴丽,范术丽,宋美珍,张红卫,喻树迅. 2010

[9]利用基因芯片技术筛选棉花产量性状相关的基因. 张利媛,于霁雯,吴嫚,马建辉,范术丽,宋美珍,庞朝友,李兴丽,张金发,喻树迅. 2013

[10]棉花纤维发育相关基因表达谱的比较分析. 于霁雯,翟红红,黄双领,李兴丽,张红卫,张金发,喻树迅. 2010

[11]烟粉虱持续取食对棉花叶片防御酶活性、营养物质和代谢产物含量的影响. 贾尊尊,付开赟,丁新华,吐尔逊·阿合买提,姜卫华,王小武,郭文超. 2022

[12]赤霉素诱导甘蔗节间伸长基因的cDNA-SCoT差异表达分析. 吴建明,李杨瑞,王爱勤,杨柳,杨丽涛. 2010

[13]斑点叉尾(鮰)血浆铜蓝蛋白的全长cDNA克隆及表达特征分析. 孟艳青,党广成,刘洋,王启龙,沙珍霞. 2013

[14]高羊茅春化基因FaVRN1亚细胞定位与差异表达分析. 王小利,吴佳海,刘晓霞,舒健虹,王舒颖. 2011

[15]cDNA-AFLP和cDNA-SRAP技术在植物基因差异表达上的应用及其分析比较. 李杨瑞,杨柳,王爱勤,杨丽涛,熊发前,甘崇昆. 2009

[16]青海高原耐旱蚕豆品种青海13号响应干旱胁迫蛋白质组学分析. 李萍,侯万伟,刘玉皎. 2019

[17]高羊茅光周期调控基因FaCONSTANS亚细胞定位与差异表达分析. 王小利,吴佳海,刘晓霞,王舒颖,舒健虹. 2011

[18]骨形态发生蛋白IB型受体(BMPR-IB)基因在蒙古羊卵巢和子宫组织中的表达分析. 何小龙,刘永斌,王峰,田春英,达赖,荣威恒. 2010

[19]甘蔗cDNA-SCoT差异显示分析PCR反应体系建立、优化及应用. 李杨瑞,杨丽涛,吴建明. 2013

[20]水稻分蘖期强势和弱势F_1基因表达差异分析. 戴正元,陈建民,肖宁,周长海. 2010

作者其他论文 更多>>