2种枇杷属植物的trnH-psbA条形码序列变异及其近缘属系统发育初步研究

文献类型： 中文期刊

第一作者： 胡文舜

作者： 胡文舜;蒋际谋;黄爱萍;许奇志;陈秀萍;郑少泉

作者机构：

关键词： 枇杷属;trnH-psbA;DNA条形码;序列分析;系统进化

期刊名称： 热带作物学报

ISSN： 1000-2561

年卷期： 2014 年 35 卷 01 期

页码： 12-16

收录情况： CSCD

摘要： 选用枇杷野生近缘种‘栎叶枇杷’和栽培种‘早钟6号’、‘香妃’,对其叶绿体基因组trnH-psbA基因间隔区进行PCR克隆与测序,利用生物信息学方法分析其序列特征,并构建苹果亚科内19个属的系统发育树。结果表明:trnH-psbA序列长323~392 bp(GenBank登录号:KF022254、KF022255、KF022256),G+C含量30.10%~33.13%,共有1个核苷酸替换(substitution)和2个插入/缺失(indel);基于trnH-psbA DNA条形码序列的分子系统进化分析结果表明,苹果亚科内形成2个大的分支,枇杷属与石斑木属的亲缘关系最近(平均遗传距离为0.055)。此结果表明叶绿体基因trnH-psbA序列可有效地进行枇杷属内物种鉴别及属间分类,是枇杷属植物DNA条形码研究的标准基因之一。

分类号： S667.3

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