烟草基因组计划进展篇:1. 烟草全长cDNA文库的构建及分析

文献类型: 中文期刊

第一作者: 龚达平

作者: 龚达平

作者机构:

关键词: 烟草基因组;计划进展;构建及分析

期刊名称: 中国烟草科学

ISSN: 1007-5119

年卷期: 2013 年 34 卷 1 期

页码: 107-108

收录情况: CSCD

摘要: 全长cDNA文库代表的是mRNA的完整拷贝,能提供完整的基因编码区信息,揭示基因的表达水平,特别是基因组测序完成后对辅助基因注释和开展功能基因研究具有重要作用。普通烟草(Nicotiana tabacum)为异源四倍体植物,基因组大小约4.5G,基因组结构高度复杂。美国烟草基因组计划对四倍体烤烟品种采用甲基过滤法测序只获得了部分基因序列信息。我国烟草基因组计划完成了对普通烟草的两个祖先种绒毛状烟草(N. tomentosiformis)和林烟草(N. sylvestris)全基因组序列图谱的绘制,更充分地验证了烟草基因组结构高度复杂这一事实。美国烟草基因组计划以及欧洲和日本烟草测序项目通过构建各种烟草不同发育时期的多个cDNA文库对基因组数据信息进行了补充。目前,在GenBank数据库中登录的烟草表达序列标签(expressed sequence tags,ESTs)超过30万条,但关于烟草全长cDNA文库的规模化构建和测序分析报道较少。烟草全长cDNA文库的构建及测序是我国烟草基因组计划的重要研究内容,目前也取得了较大进展。

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