马氏珠母贝EST微卫星的筛选

文献类型： 中文期刊

第一作者： 石耀华

作者： 石耀华;洪葵;郭希明;王嫣;侯占辉;顾志峰;王爱民

作者机构：

关键词： 马氏珠母贝;EST-SSR;分子遗传学

期刊名称： 水产学报

ISSN： 1000-0615

年卷期： 2008 年 32 卷 02 期

页码： 174-181

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 构建了马氏珠母贝的血液、足、鳃、胃、肝、心脏、外套膜、珍珠囊和感染多毛虫马氏珠母贝的血液(血感)等9个组织的cDNA文库,测序获得了6979个EST序列,从中查找到了268个重复序列,隶属于243个EST,含微卫星的EST数占EST总数的3.48%。珍珠囊cDNA文库含微卫星的序列所占比例最高,为6.16%,血感的最低,为1.65%。双碱基重复序列130个,占48.5%,(AT/AT)n类型最常见;三碱基类型的83个,占约31%,其中(AAT/ATT)n和(AAG/CTT)n较多;四碱基重复的有30个,占11.2%,(AAAT/ATTT)n占了该类型的约50%。一共能够设计151对微卫星引物,有130对可以扩增,占合成引物总数的86.09%,其中,多态性引物45对。多态性EST-SSR的筛选将为马氏珠母贝的分子遗传学研究、种质鉴定和野生资源保护等提供可靠的工具。

分类号： S917.4

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