海南木豆丛枝植原体质粒全序列测定及分析
文献类型: 中文期刊
第一作者: 李玲婷
作者: 李玲婷;车海彦;曹学仁;杨毅;罗大全
作者机构:
关键词: 木豆丛枝植原体;质粒;序列分析
期刊名称: 热带作物学报
ISSN: 1000-2561
年卷期: 2014 年 35 卷 07 期
页码: 1404-1408
收录情况: 北大核心 ; CSCD
摘要: 提取木豆叶片基因组总DNA,通过克隆,测序木豆丛枝植原体海南株系质粒(pPPWB-Hn)的完整DNA序列,并使用生物信息学软件对该质粒全长序列进行分析。分析结果显示:pPPWB-Hn质粒全长4 218 bp,含有4个开放阅读框,分别编码Rep、dnaG、threonine synthase和未知蛋白。其中,Rep是2次跨膜蛋白,dnaG是单次跨膜蛋白,Rep和dnaG均与质粒自主复制有关。Rep和未知蛋白可能分布在细胞质中,dnaG可能定位到细胞膜上或膜外,Threonine synthase可能定位到线粒体膜上或线粒体内腔。系统进化树显示:pPPWB-Hn与植原体16SrⅡ组的pPNWB(AY270152),pTBBperi(DQ119297)及pTBBcap(DQ119296)处在同一进化分支。
分类号: S432.4
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