基于线粒体DNAD-loop区全序列分析大围山微型鸡遗传多样性及其起源进化关系的研究

文献类型： 中文期刊

第一作者： 贾晓旭

作者： 贾晓旭;唐修君;陆俊贤;顾荣;葛庆联;高玉时;苏一军

作者机构：

关键词： 大围山微型鸡;线粒体DNA;D-loop区;系统发育关系;起源

期刊名称： 南京农业大学学报

ISSN： 1000-2030

年卷期： 2015 年 38 卷 04 期

页码： 656-660

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： [目的]探究大围山微型鸡的遗传多样性和起源。[方法]对30只大围山微型鸡线粒体DNA(mitochondrial genome,mt DNA)D-loop区全序列进行PCR扩增和测序,并结合GenBank已登录红色原鸡的D-loop区全序列,运用现代生物信息学方法进行数据处理。[结果]试验结果表明:大围山微型鸡mt DNA D-loop区全长1 231~1 232 bp,1 231 bp单倍型在859 bp处存在C碱基缺失。核苷酸多样性(Pi)为0.004 43±0.000 14,单倍型多样性(Hd)为0.685±0.079,核苷酸平均差异数(K)为5.448。在30只个体中,共发现18处单核苷酸多态位点,6种单倍型。系统发育分析发现,6种单倍型可以分为A、B、D和E 4个分支,其中A和B为主要分支。A和B分支各有2种单倍型,D和E分支均只有1种单倍型。A和B分支与红色原鸡滇南亚种(Gallus gallus spadiceus)聚为一类。[结论]大围山微型鸡mt DNA D-loop区有丰富的多态性,并且有多个母系起源,红色原鸡滇南亚种在大围山微型鸡形成过程中贡献最大。

分类号： S831.2

  • 相关文献

[1]文昌鸡线粒体控制区遗传多态性及系统进化分析. 章明,贾晓旭,陆俊贤,唐修君,樊艳凤,高玉时. 2016

[2]基于线粒体基因组D-loop区全序列分析安义瓦灰鸡遗传多样性及其起源进化关系. 高玉时,贾晓旭,唐修君,唐梦君,樊艳凤,陆俊贤,顾荣,葛庆联,苏一军. 2015

[3]云龙矮脚鸡系统进化及遗传多样性的研究. 贾晓旭,唐修君,陆俊贤,顾荣,葛庆联,高玉时,苏一军. 2015

[4]基于线粒体DNAD-loop区全序列分析藏鸡遗传多样性及其起源进化关系的研究. 贾晓旭,唐修君,陆俊贤,顾荣,葛庆联,高玉时,苏一军. 2015

[5]德化黑鸡线粒体DNA控制区全序列测定及起源研究. 贾晓旭,陆俊贤,唐修君,顾荣,葛庆联,高玉时. 2015

[6]河南斗鸡线粒体D-loop区多态性及与4种斗鸡的进化分析. 贾晓旭,陆俊贤,唐修君,唐梦君,樊艳凤,顾荣,高玉时,苏一军. 2015

[7]中国家鸭的分子遗传多态性及其起源. 李慧芳,陈宽维,朱文奇,薛素美,宋卫涛,王光瑛. 2009

[8]基于线粒体DNA D-loop区全序列分析儋州鸡遗传多样性及其起源进化关系. 李义书,侯冠彧,曹婷,施力光,周汉林,周雄. 2019

[9]我国蛋用型地方鸡品种遗传多样性分析. 陆俊贤,贾晓旭,唐修君,樊艳凤,唐梦君,高玉时,苏一军. 2016

[10]2个云南原始鸡种遗传多样性及其与红色原鸡的亲缘关系. 陆俊贤,贾晓旭,唐修君,樊艳凤,唐梦君,高玉时,苏一军. 2016

[11]野牦牛(Bos grunniens mutus)mtDNA D-Loop区的遗传多样性. 马志杰,钟金城,韩建林,徐惊涛,窦全林,常怀普. 2009

[12]基于mtDNA控制区2个地方鸡品种遗传多样性及起源研究. 唐修君,贾晓旭,樊艳凤,葛庆联,唐梦君,周倩,陆俊贤,韩威,高玉时. 2021

[13]基于mtDNA控制区遗传变异分析大骨鸡遗传多样性及系统进化. 唐修君,贾晓旭,樊艳凤,高玉时,葛庆联,唐梦君,陆俊贤,顾荣,刘茵茵. 2019

[14]基于线粒体Cytb基因和D-loop区的野生与养殖小黄鱼群体遗传多样性. 郭丹丹,刘峰,牛宝龙,楼宝. 2022

[15]基于线粒体D-loop区分析茶花鸡遗传多样性和起源进化. 范梅华,唐修君,贾晓旭,樊艳凤,葛庆联,陆俊贤,韩威,高玉时. 2019

[16]水鹿的分子鉴定. 查代明,邢秀梅,杨福合. 2010

[17]基于线粒体标记的淮南麻黄鸡遗传结构及其遗传多样性分析. 黄胜海,贾晓旭,陆俊贤,唐修君,樊艳凤,葛庆联,高玉时. 2018

[18]边鸡遗传多样性及其起源进化的研究. 贾晓旭,唐修君,樊艳凤,陆俊贤,葛庆联,黄胜海,高玉时. 2018

[19]寿光鸡遗传多样性及其起源进化的研究. 贾晓旭,唐修君,樊艳凤,陆俊贤,葛庆联,黄胜海,高玉时. 2019

[20]石岐鸽mtDNA Cytb基因遗传多样性分析. 贾晓旭,陆俊贤,唐修君,叶俊文,樊艳凤,马尹鹏,李正晟,许小飞,高玉时. 2023

作者其他论文 更多>>

微信小程序