芥菜WOX基因家族的全基因组鉴定与分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 阳文龙

作者： 阳文龙;徐楚;韩嘉琪;张晓辉;宋江萍;贾会霞;王海平

作者机构：

关键词： 芥菜;WOX基因家族;生物信息学分析

期刊名称： 生物工程学报

ISSN： 1000-3061

年卷期： 2023 年 002 期

页码： 537-551

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： WUSCHEL相关-同源盒（WUSCHEL related-homeobox, WOX）基因家族是一类植物特有的转录因子基因家族，在植物的生长发育过程中发挥重要作用。本研究利用芥菜（Brassica juncea）基因组数据，通过HUMMER、Smart等软件进行检索筛选，共鉴定出51个WOX基因家族成员。利用Expasy在线软件对这些家族成员的蛋白质分子量、氨基酸序列长度、等电点等进行分析，并利用生物信息学软件对芥菜WOX基因家族进化关系、保守区域、基因结构等进行系统性分析，将芥菜WOX基因家族分为古老支、中间支和WUS支/现代支3个亚家族。结构分析表明，同一亚家族内的WOX转录因子家族成员的保守结构域的种类、组织形式以及基因结构具有高度的一致性，而不同亚家族之间呈现一定的多样性。51个WOX基因不均匀分布于芥菜18条染色体上，这些基因的启动子大多含有响应光、激素和非生物逆境胁迫相关的顺式作用元件。利用转录组数据和实时荧光定量PCR （real-time fluorescence quantitative PCR, qRT-PCR）分析发现，芥菜WOX基因的表达具有时空特异性，其中BjuWOX25、BjuWOX33、BjuWOX49可能在角果的发育中发挥重要作用，BjuWOX10、BjuWOX32和BjuWOX11、BjuWOX23分别在干旱和高温胁迫响应中具有重要功能。上述结果为芥菜WOX基因家族的功能研究奠定了基础。

分类号： Q943.2%S637

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