苦荞FtHCT的基因克隆与生物信息学分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 杨晓琳

作者： 杨晓琳;段迎;蔡苏云;贺润丽;尹桂芳;王艳青;卢文洁;孙道旺;王莉花

作者机构：

关键词： 苦荞;HCT;基因克隆;生物信息学;表达分析

期刊名称： 分子植物育种

ISSN： 1672-416X

年卷期： 2023 年 001 期

页码： 102-109

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 本研究克隆木质素生物合成途径关键酶莽草酸/奎宁酸羟基肉桂酰转移酶（HCT），探究苦荞HCT基因的表达调控以及对苦荞果壳发育形成的影响。运用RT-PCR技术克隆获得两条苦荞HCT基因，命名为Ft HCT-1、FtHCT-2，对两基因编码蛋白进行生物信息学分析，对不同组织器官及果壳不同时期混合材料进行RT-qPCR表达分析。结果表明：FtHCT-1、FtHCT-2开放阅读框序列长度分别为1 347、1 278 bp，各编码448和425个氨基酸，蛋白分子量分别为49.66和46.57 kD，理论等电点为5.72和6.64，均为亲水性蛋白，处在细胞质内，均属于PLNO2481和Trasferase超家族，具有高度同源。两基因表达存在明显差异。本研究克隆所得两条HCT基因在苦荞果壳生长发育中特定表达，推断其表达影响苦荞果壳木质素合成，为薄果壳形成的关键基因。

分类号： S517

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