基于SLAF-seq玉米高密度遗传连锁图谱构建与株型性状QTL定位

文献类型： 中文期刊

第一作者： 薛春雷

作者： 薛春雷;吴慧;逯晓萍;韩平安;孙峰成;张来厚

作者机构：

关键词： 玉米;SLAF-seq技术;高通量测序;高密度遗传连锁图谱;株型

期刊名称： 科技导报

ISSN： 1000-7857

年卷期： 2021 年 39 卷 014 期

页码： 144-154

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 株型直接决定生物产量、种植密度与籽粒产量,利用玉米高密度遗传连锁图谱解析株型相关性状的遗传机制,对选育理想株型玉米新品种具有重要意义.本研究利用SLAF-seq技术,依据玉米黄早四参考基因组信息,对昌7-2与PHB1M及其138个F2:3家系高通量测序,开发高密度SNP的遗传图谱,并进行株型相关性状QTL定位.研究结果构建了一张总图距为1354.81 cM,标记间的平均距离为0.32 cM,标记数为4220个SLAF标签(7876个SNP)的高密度遗传图谱.在E1与E2两种密度下,对株高、穗位、叶片数、节间数、平均节间长进行QTL定位,共检测到10个QTL位点,其中,有7个PVE超过了10%.叶片数、穗位、节间数为主效QTL,ADD为负值,叶片数与节间数的减效等位基因来源于PHB1M,穗位的减效等位基因来源于昌7-2.叶片数与节间数在2个密度下均定位在8号染色体上,说明二者之间有着共同的遗传机制.与QTL关联的SLAF标记共有61个,其中,SLFA7305498和SLFA6717271为qLC-2-LG8与qIC-2-LG8共有标记.该研究将为玉米株型相关性状的标记辅助选择提供支撑.

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