基于Illumina Miseq分析肉驴皮肤病灶中真菌菌群的组成

文献类型： 中文期刊

第一作者： 樊坤

作者： 樊坤;鲍宇茹;刘阳;王佳奇;梁俊杰;王子朝;王雪琴;白朋勋;张慧茹

作者机构：

关键词： 驴;皮肤病;Illumina Miseq;高通量测序;真菌菌群组成;高丰度菌群

期刊名称： 黑龙江畜牧兽医

ISSN： 1004-7034

年卷期： 2020 年 06 期

页码： 83-86+156

收录情况： 北大核心

摘要： 为了研究肉驴皮肤病灶中真菌菌群的组成,为科学防治驴皮肤病提供依据,试验采用Illumina Miseq分析方法,从天津某肉驴养殖合作社的养殖场采集不同临床症状的驴皮肤病病灶样本37份,挑选6份具有典型临床症状的皮肤病灶样本,对驴皮肤病灶中真菌菌群进行分析,包括Alpha多样性分析、群落结构组成、PCoA多样性分析、物种Venn图分析。结果表明:送检的6份样本检出真菌菌群种类覆盖3门、8纲、13目、19科、21属。在属水平上,优势菌属为毛霉(Mucor),占15.90%;Papiliotrema,占12.60%;红酵母(Rhodotorula),占9.80%;汉纳酵母(Hannaella),占7.40%。致病性真菌有念珠菌(Candida)和赤霉菌(Gibberella)。通过PCoA和Venn图分析,皮肤出血性样本的菌群组成相似,酵母目(Saccharomycetales)和黑粉菌(Filobasidium)为高丰度菌群;Vishniacozyma是驴皮硬化的高丰度菌群;西氏酵母(Naganishia)是驴皮皮屑的高丰度菌群。说明驴皮肤病灶中真菌菌群的组成具有明显的差异性和高丰度菌群,为后期进一步研究提供基础数据。

分类号： S858.22

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