基于COI部分序列探讨南海鲳属鱼类系统进化与种群遗传结构
文献类型: 中文期刊
第一作者: 孙鹏
作者: 孙鹏;尹飞;施兆鸿;彭士明
作者机构:
关键词: 鲳属鱼类(Pampus);细胞色素c氧化酶亚基Ⅰ(COI);序列变异;系统进化
期刊名称: 海洋科学
ISSN: 1000-3096
年卷期: 2012 年 36 卷 06 期
页码: 15-21
收录情况: 北大核心 ; CSCD
摘要: 利用线粒体细胞色素c氧化酶Ⅰ亚基(COI)部分序列研究了南海区鲳属鱼类(Pampus)银鲳(P.ar-genteus)、珍鲳(P.minor)和中国鲳(P.chinensis)的系统进化与种群遗传结构。通过PCR扩增与序列测定获得了长度为643 bp的COI基因片段,其A、T、G、C碱基的平均含量分别为25.4%、33.6%、18.9%和22.1%,A+T含量高于G+C含量。64条序列共定义了20种单倍型,包含152个变异位点,简约信息位点148个,单变异位点4个,产生169个点突变。结果表明,银鲳与中国鲳的遗传差异最小,银鲳与珍鲳的其次,而珍鲳与中国鲳的遗传差异最大,3种鲳属鱼类的遗传多样性均呈现较低的水平,应采取有效的保护措施,以避免其遗传多样性水平的进一步丧失。本研究结果为鲳属鱼类资源保护和合理开发利用提供必要的参考。
分类号: S917.4
- 相关文献
[1]3种鲳属鱼类线粒体COI基因序列变异及系统进化. 张凤英,马凌波,施兆鸿,马春艳. 2008
[2]基于环境DNA宏条形码技术的辽东湾典型围海养殖池塘内水母多样性研究. 李玉龙,鲍相渤,李轶平,周遵春,付杰,高祥刚,陈百灵,李云峰. 2022
[3]粳稻超亲变异系籽粒谷氨酰胺合成酶基因表达特性及序列变异分析. 徐振华,曲莹,刘海英,朱立楠,张忠臣,金正勋. 2016
[4]重庆南瓜病毒病病原ELISA检测及CMV变异分析. 青玲,包凌云,周常勇,杨水英,孙现超. 2010
[5]MIC5基因在13株不同基因型的刚地弓形虫中的序列变异(英文). 刘文阁,徐晓佩,陈佳,朱兴全,徐前明. 2015
[6]中国葡萄类病毒基因多样性分析及其新种的发现. 姜冬梅,郭瑞,彭山,吴祖建. 2009
[7]葡萄A病毒辽宁分离物外壳蛋白基因克隆及序列变异分析. 任芳,范旭东,董雅凤,张尊平,王教敏. 2012
[8]罗非鱼选育群体Cytb与D-loop序列变异信息对比分析. 颉晓勇,李思发. 2014
[9]大豆盐胁迫相关GmNAC基因的鉴定、表达及变异分析. 张彦威,张礼凤,李伟,王彩洁,张军,徐冉. 2016
[10]珠母贝属6个种的ITS 2分子标记研究. 喻达辉,朱嘉濠. 2005
[11]秀丽白虾3个地理种群mtDNA 16S rRNA基因序列变异及遗传分化. 张敏莹,徐东坡,方弟安,周彦锋,刘凯. 2018
[12]GRA24基因在不同地理位置和宿主来源的刚地弓形虫株间的序列变异(英文). 徐晓佩,刘文阁,陈佳,朱兴全,徐前明. 2015
[13]细胞核rDNA序列用于罗非鱼及其杂交种鉴别的初步研究. 郭奕惠,喻达辉. 2009
[14]细胞核rDNA序列分析5种罗非鱼的亲缘关系. 郭奕惠,喻达辉,黄桂菊,符云,叶卫. 2009
[15]细胞质雄性不育高粱叶绿体ndh D基因的序列变异(英文). 范昌发,孙春昀,郭骁才,张福耀,孙毅,牛天堂,贾敬芬. 2002
[16]桃树啤酒花矮化类病毒(HopStuntViroid;HSVd)的鉴定及序列变异分析. 李世访,成卓敏,赵剑波,姜全. 2006
[17]一种降低dATP用量的简单易错PCR方法. 高义平,赵和,吕孟雨,孙果忠,杨学举,王海波. 2014
[18]水稻孤雌生殖诱导基因BBM1序列变异分析. 汪晴,王艳茹,张秀丽,吕启明. 2024
[19]中国矮马群体mtDNA Cytb基因遗传多样性及系统进化研究. 徐龙鑫,杨胜林,李爱萍,乜玉丽,杨海兵,戴焰. 2013
[20]线粒体DNA的研究与应用. 熊庆,刘作易,喻子牛. 2002
作者其他论文 更多>>
-
不同抗流能力大黄鱼组织抗氧化能力、肌肉超微结构及相关基因表达的比较研究
作者:张静静;王亚冰;乔光德;王倩;韩多彩;彭士明
关键词:大黄鱼;抗流能力;组织结构;抗氧化酶;基因表达
-
菠萝带状旋耕开沟机刀辊轴设计与试验
作者:孙鹏;李海亮;孙海天;王宏轩;孙伟生;汪春
关键词:菠萝;旋耕机刀辊;SolidWorks;有限元;模态分析
-
茶薪菇'赣茶AS-5'担孢子单核体菌株的交配型鉴定及菌丝生长速度
作者:彭新红;刘颖聪;陈绪涛;孙鹏;戴丹;胡佳;王振;戴建成;魏云辉
关键词:茶薪菇;交配型;OWE-SOJ技术;核迁移试验;分子鉴定;菌丝生长
-
对92个茶树菇菌株的遗传多样性分析和农艺性状的评价
作者:王洪秀;章炉军;孙鹏;胡佳;安颖;陈绪涛;魏云辉
关键词:茶树菇(Agrocybe aegerita);拮抗反应;简单序列重复区间;遗传多样性;农艺性状
-
马夫鱼室内人工育苗试验
作者:岳彦峰;蒋科技;彭士明;叶丙聪;王孝杉
关键词:
-
玉米烘干自动监控系统设计
作者:田新庆;陈武东;孙鹏;温海江;于占海;马文军;侯艳芳;任嘉宇
关键词:玉米烘干;自动监控系统;DCS;温度和湿度监测;产品质量
-
梭伦小剥管孔菌生物学特性和驯化栽培
作者:戴丹;王振;胡佳;戴建成;彭新红;孙鹏;陈绪涛;王志伟;魏云辉;李玉
关键词:单因素试验;正交试验;生长条件;菌丝生长速率