甜菜MAPK蛋白家族及尾孢菌侵染的转录表现分析
文献类型: 中文期刊
第一作者: 马子淞
作者: 马子淞;赵春雷;王希;李彦丽;贾海伦;丁广洲;陈丽
作者机构:
关键词: 丝裂原活化蛋白激酶(MAPK);甜菜;生物信息学分析
期刊名称: 分子植物育种
ISSN: 1672-416X
年卷期: 2025 年 23 卷 001 期
页码: 60-70
收录情况: 北大核心 ; CSCD
摘要: MAPK是真核细胞中普遍存在的一种信号转导模块因子,在植物的免疫应答和发育分化等过程中发挥重要的作用。本研究筛选鉴定甜菜MAPK (丝裂原活化蛋白激酶)基因家族的成员,分析其蛋白保守结构域、基因结构、进化关系、染色体定位、蛋白互作和3D结构。通过生物信息学手段共筛选鉴定到7个甜菜MAPK家族成员,其Gene ID分别为LOC104887071、LOC104893685、LOC104892250、LOC104889027、LOC-104903118、LOC104907978和LOC104889438。此外,MAPK家族基因不均匀地分布在4条染色体上,其基因编码的蛋白包含366~604个不等的氨基酸,其分子量介于42 144.29~68 964.33 Da之间,等电点介于5.40~8.85,属于弱酸性和弱碱性蛋白,外显子数量4~11个,BVMAPK2和BvMAPK6的T-LOOP环为TDY,亚细胞定位多数位于细胞质上。分析蛋白基序11个,其中模体6为T-LOOP。在假定启动子区预测的顺式作用元件表明甜菜MAPK家族受生物和非生物胁迫及激素的影响。本研究为利用甜菜MAPK家族基因的功能提供参考,为甜菜育种中的遗传改良提供理论依据。
分类号: S435.663
- 相关文献
[1]植物基因克隆实现方法及甜菜基因克隆相关研究现状. 申子萌,王希,徐悦,陈丽. 2021
[2]甘蔗核苷二磷酸激酶(NDPK1)基因克隆及表达分析. 李杨瑞,杨丽涛. 2012
[3]花生谷氨酸脱氢酶基因AhGDH1的克隆与生物信息学分析. 陈湘瑜,徐日荣,林栩松,唐兆秀. 2016
[4]灰毡毛忍冬MADS-box基因家族AGL15基因的克隆、生物信息学和表达分析. 蔡嘉洛,朱贻霖,陈林,樊悦,刘峰,张亚丽,欧阳琳,刘湘丹. 2016
[5]柞蚕腺苷酸转移酶基因的克隆与序列分析. 李玉萍,王欢,武松,夏润玺,刘彦群,秦利,李喜升,姜德富. 2009
[6]大豆FLAs蛋白理化性质和结构特征的生物信息学分析. 吴小明,胡颖. 2017
[7]栽培种花生FAE1基因的克隆和序列分析. 张欣,孙全喜,吴琪,王秀贞,胡东青,唐月异,王志伟,宋国生,徐建志,殷冬梅,王传堂. 2018
[8]高致病性猪繁殖与呼吸综合征病毒JL株Nsp10基因生物信息学分析. 周思旋,徐健,周碧君,王开功. 2012
[9]枣树抗坏血酸过氧化物酶基因ZjAPX生物信息学分析及植物表达载体的构建. 郝子琪,许洪仙,孟玉平,曹冬梅,曹秋芬. 2011
[10]小偃麦异附加系TaXTH基因的克隆与生物信息学分析. 黄春丽,宋静,李全权,郭庆东,田秋菊,高居荣,王洪刚,封德顺. 2015
[11]牦牛Agouti基因的克隆及编码区多态性研究. 张建一,梁春年,吴晓云,张良斌,郭宪,裴杰,阎萍. 2014
[12]野蚕孵化酶基因的克隆与生物信息学分析. 唐顺明,赵新慧,吴俊,裘智勇,沈兴家. 2011
[13]小菜蛾p38 MAPK基因的克隆与生物信息学分析. 胡霞,谷希树,刘晓琳,白义川,徐维红,刘佰明,许静杨. 2013
[14]苦荞Ft4CL基因克隆、生物信息学及分子进化分析. 侯思宇,赵盖超,刘荣华,孙朝霞,令狐斌,韩渊怀,许冬梅,李红英. 2015
[15]小麦ent-柯巴基焦磷酸合酶基因TaCPS1的克隆与荧光定量分析. 郭庆东,李全权,田秋菊,钱艳丽,许田,杨艳林,王洪刚,封德顺. 2016
[16]小花碱茅HKT2;1基因全长cDNA的克隆与生物信息学分析. 李剑,张金林,王锁民,郭强. 2013
[17]水稻α-NAC基因家族的克隆及生物信息学分析. 王晓静,孙林静,马忠友,孙玥,李军玲,张融雪,闫双勇,刘学军. 2016
[18]水稻OsPP6C基因的克隆、过表达载体构建与生物信息学分析. 王青云,王润青,方聪燕,侯佩,苏亮,李建平,宋梅芳,杨建平,李雪梅,吴大付. 2013
[19]小菜蛾PxALP1基因的克隆与生物信息学分析. 胡霞,刘晓琳,白义川,徐维红,刘佰明,邹德玉,许静杨,谷希树. 2017
[20]猪沙波病毒CH430株p70基因克隆与生物信息学分析. 刘伟,王恩丽,柳纪省,杨彬,兰喜. 2014
作者其他论文 更多>>
-
光质对蓝莓果实品质的影响
作者:裴嘉博;刘辉;钟林炳;骆慧枫;刘禹姗;阮若昕;张琛;陈丽;郗笃隽
关键词:蓝莓;红光;蓝光;果实品质
-
不同基质配方处理对蓝莓果实产量及品质的影响
作者:裴嘉博;刘辉;马振华;钟林炳;骆慧枫;刘禹姗;邓宇;黄康康;张琛;陈丽;高国忠;郗笃隽
关键词:蓝莓;基质;果实品质
-
基于遗传算法-反向传播神经网络优化高压-超声-酶解法提取羊皮胶原蛋白工艺
作者:朱明;张德权;李少博;陈丽;侯成立;程成鹏;于江颖;关文强
关键词:羊皮;羊皮胶原蛋白;高压-超声-酶解法;遗传算法-反向传播神经网络;响应面法
-
基于多光谱技术的甜菜块根糖分增长期施氮决策模型
作者:王敬云;胡晓航;董心久;马亚怀;李彦丽
关键词:甜菜;多光谱;氮肥推荐;植被指数;无人机遥感
-
三种食药用菌对不同化学药剂安全性的评估研究
作者:杨学圳;黄钰;陈丽;张波;叶雷;李小林;王军
关键词:相对生长速率;变异系数;Pearson相关系数;灵芝;羊肚菌
-
基于电子鼻和顶空固相微萃取结合气相色谱-嗅闻-质谱联用技术分析不同品种羊肉煮制风味特征
作者:陈鹏羽;张德权;李少博;王卫;徐乐;张佳敏;张锐;陈丽
关键词:羊肉;煮制;气相色谱-嗅闻-质谱联用;产地溯源;挥发性风味物质
-
蓝莓新品种瑞月的选育
作者:孙海悦;雷蕾;董梅;田友文;陈丽;和加卫;李亚东
关键词:蓝莓;新品种;瑞月