亚洲棉NF-YA基因家族的全基因组鉴定及表达分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 王园园

作者： 王园园;赵春月;孙润润;秦腾飞;张金宝;郑巨云;杨秋月;翟勇全;孙家良;王清连

作者机构：

关键词： 亚洲棉（Gossypium arboretum L.）;核因子Y;基因家族;生物信息学;表达模式

期刊名称： 分子植物育种

ISSN：

年卷期： 2021 年 014 期

页码： 4564-4573

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： NF-YA家族基因在植物生长发育过程中发挥重要作用,如调控种子发育和种子萌发,响应干旱和盐胁迫等。本研究利用生物信息学手段从亚洲棉全基因组鉴定NF-YA家族基因,并从理化性质、基因的内含子和外显子结构、氨基酸序列的功能结构域、系统进化发育特征、在染色体的分布和表达模式等方面分析了该家族基因的特征。结果表明:GaNF-YA包含15个成员,分布在9条染色体上,编码蛋白质长度为160～1 079个氨基酸,相对分子质量为17.92～120.30 kD,包含外显子4～6个,为碱性。亚洲棉NF-YA基因可分为三组,且三组NF-YA基因结构存在差异,保守基序分析其均含有A1和A2结构域。通过对启动子顺式作用元件和表达谱分析,推测GaNF-YA基因可能在棉花种子和纤维形成、种子萌发及环境胁迫等中具有重要作用。本研究为进一步解析亚洲棉NF-YA家族基因的功能提供理论依据。

分类号： S562

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