2020-2023年甘肃猪繁殖与呼吸综合征病毒的基因遗传变异分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 焦守德

作者： 焦守德;张婧;李平花;王健;韩庆彦;张雨星;魏达礼;王方洲;白兴文;卢曾军;马雪青;孙普

作者机构：

关键词： 猪繁殖与呼吸综合征病毒;ORF5;NSP2;ORF3;遗传变异

期刊名称： 中国兽医科学

ISSN： 1673-4696

年卷期： 2024 年 54 卷 011 期

页码： 1482-1490

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 为了了解甘肃地区猪群中猪繁殖与呼吸综合征病毒（PRRSV）的流行及遗传变异情况，采用反转录聚合酶链反应（RT-PCR）方法对2020-2023年收集的猪组织样品进行PRRSV ORF5、NSP2和ORF3基因扩增并测序，通过MEGA软件构建遗传进化树进行遗传变异分析。结果显示，共检测了52份猪临床样品，PRRSV核酸阳性率为61.5%(32/52)，成功获得了32条ORF5、15条NSP2和14条ORF3基因序列。ORF5基因遗传进化分析表明，2020—2023年甘肃地区猪群中PRRSV流行毒株中存在美洲型1.5谱系（4株）、1.8谱系（24株）、5.1谱系（2株）、8.7谱系（2株）；NSP2基因遗传进化分析表明，获得的15条NSP2序列均为1.8谱系；ORF3基因遗传进化分析表明，获得的14条ORF3序列包括1.5谱系（2株）、1.8谱系（11株）、3.5谱系（1株）。基因核苷酸序列与参考毒株的同源性分别为ORF5 82.3%～99.7%、NSP2 85.9%～90.0%和ORF3 89.8%～95.7%；基因编码氨基酸序列与参考毒株的同源性分别为ORF5 79.6%～99.0%、NSP2 83.4%～87.7%和ORF3 85.1%～94.5%。ORF5基因编码的GP5蛋白的信号肽区、高变区、细胞表位区等区域均存在不同程度的变异，其中5株毒株的第33位氨基酸出现了缺失；15株NSP2蛋白氨基酸序列的缺失模式与NADC30株一致。上述结果表明，当前甘肃地区猪群中PRRSV呈现以1.8谱系毒株为优势的美洲型多谱系共循环流行，这对甘肃地区防控PRRSV提供了重要的流行病学数据。

分类号： S852.651

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