植物DNA甲基转移酶的生物信息学分析
文献类型: 中文期刊
第一作者: 吴春太
作者: 吴春太;李维国;高新生;张晓飞
作者机构:
关键词: DNA甲基转移酶;生物信息学;DNA甲基化
期刊名称: 西南大学学报(自然科学版)
ISSN: 1673-9868
年卷期: 2010 年 32 卷 04 期
页码: 83-89
收录情况: 北大核心 ; CSCD
摘要: 运用生物信息学的方法和软件对油棕、桃树、豌豆、胡萝卜、拟南芥等植物的DNA甲基转移酶的核酸及其氨基酸序列进行了组成成分、理化性质、同源性比对分析,进而对其信号肽、跨膜结构域、疏水性和亲水性、蛋白质二级及三级结构、分子系统进化等重要参数进行预测和推断.结果表明:DNMT的全长cDNA包括5非翻译区、一个开放阅读框和3非翻译区,该蛋白无信号肽和蛋白转运肽,是一个亲水性蛋白,具有两个BAH和一个DNA甲基化酶结构域,其二级结构以α-螺旋和无规则卷曲为主要结构元件,各个结构域之间可以依靠静电作用依次结合.
分类号: Q943.2
- 相关文献
[1]DNA甲基化作用的生物学功能. 郑小梅,伍宁丰. 2009
[2]巴西橡胶树HbMET的克隆与表达分析. 郭冬,汪晗,杨子平,彭世清. 2015
[3]绵羊母源基因TRIM28克隆、表达及生物信息学分析. 罗健,王立民,张译元,郭延华,唐红,周平,刘守仁. 2017
[4]DNA甲基化的植物学意义及其研究方法. 李坤怿,袁文娅,王鹏文. 2017
[5]大口黑鲈溃疡综合征病毒甲基转移酶基因序列分析与原核表达. 马冬梅,白俊杰,邓国成,李胜杰. 2011
[6]基因组印记重组与胚胎发育. 陈琦,张立岭,赵静,马月辉,张剑平. 2009
[7]棉花GhDMT7基因对5-氮杂胞嘧啶核苷的响应机制. 杨志宁,陆许可,范亚朋,孙玉平,喻欣,王亮,高永健,古丽加依那什·哈不力,古丽沙西·拿斯依,吾木尔·阿不都,黄慧,张梦豪,王立东,陈筱,肖磊,张鑫蕊,王帅,陈修贵,王俊娟,郭丽雪,高文伟,叶武威. 2025
[8]动物印迹基因与胚胎发育关系的研究进展. 王世锋,陈静波,刘明军. 2011
[9]犏牛及其亲本IGF2基因mRNA表达水平、DNA甲基化状态差异分析. 刘振山,李齐发,张庆波,屈旭光,董丽艳. 2009
[10]不同倍性西瓜基因组DNA甲基化水平与模式的MSAP分析. 王春国,古瑜,陈成彬,焦定量,薛振毅,宋文芹. 2009
[11]火龙果MSAP体系的优化及组培苗DNA甲基化检测. 刘鹏飞,乔光,刘涛,彭志军,蔡永强,晓鹏. 2016
[12]逆境胁迫下植物DNA甲基化变异的研究进展. 徐妍,张海玲,徐香玲,张会新,姚琳,张必弦,王全伟. 2014
[13]氮胁迫下高羊茅基因组DNA甲基化的MSAP分析. 王小利,王茜,舒健虹,蔡一鸣,刘彬,吴佳海. 2015
[14]干旱驯化后节水抗旱稻苗期不同发育时间DNA甲基化模式变化分析. 郑小国,陈亮,楼巧君,夏辉,李明寿,罗利军. 2014
[15]DNA甲基化及其生物学功能. 沈秀平,林月霞,徐琪. 2012
[16]表观遗传学研究方法进展. 郑小国,陈亮,楼巧君,罗利军. 2011
[17]DNA甲基化对植物生长发育的调控研究. 周颖. 2015
[18]植物中表观遗传修饰研究进展. 郑小国,陈亮,罗利军. 2013
[19]干旱胁迫对老芒麦DNA表观遗传变化的MSAP分析. 闫伟红,马玉宝,陈云,王凯,孟庆伟,张晶然. 2016
[20]急性温度胁迫对虾夷扇贝(Patinopecten yessoensis)基因组DNA甲基化的影响. 吴彪,杨爱国,孙秀俊,刘志鸿,周丽青,宫一震. 2016
作者其他论文 更多>>
-
耐寒抗风高产橡胶树品种培育及其应用
作者:黄华孙;李维国;和丽岗;李国华;李智全;林位夫;高新生;谢黎黎;曾霞;黄飞
关键词:
-
橡胶树5个主栽品种对日间割胶模式的响应研究
作者:丁世涛;高新生;黄肖;周元元
关键词:橡胶树;割胶;鲜胶产量;干胶含量;生理参数;品质;品种
-
基于土壤背景剔除的玉米早期根域土壤含水率反演方法研究
作者:张彦;贺佳;张晓飞;郭燕;杨秀忠;张红利;刘婷;位盼盼;王来刚
关键词:玉米早期;表层土壤含水率;无人机;热红外;可见光;植被覆盖度
-
橡胶树三倍体品种的2n雌配子形成途径再鉴定
作者:张源源;吴桂海;龙青姨;黄肖;高新生;李维国
关键词:橡胶树;2n雌配子;第二次减数分裂核复原(SDR);三倍体
-
21个品系橡胶树的叶片解剖特征研究
作者:杨雨;胡欣欣;丁世涛;袁志能;黄肖;欧阳宇珺;高新生
关键词:橡胶树;叶片解剖;聚类分析
-
橡胶树品种热试11-107比较试验初报
作者:张晓飞;黄肖;张源源;李维国
关键词:橡胶树;引进品种;比较试验;评价;适应性
-
高山美利奴羊肉品质分析及脂肪酸特征研究
作者:文亚洲;韩登武;王喜军;张晓飞;刘继刚;刘建斌
关键词:高山美利奴羊;肉品质;脂肪酸;氨基酸
